نقشه يابي ژن آنتوسيانين ساقه برنج (Oryza sativa L.) با استفاده از نشانگرهاي مولكولي ريزماهواره

Molecular Tagging of Stem Anthocyanin Gene in Rice Using SSR Markers

وجود رنگدانه هاي آنتوسيانين در برنج و ساير گياهان عامل اصلي توليد ساقه ارغواني رنگ محسوب مي-شود. درك درست از مسير بيوسنتزي آنتوسيانين باعث توسعه ابزار قدرتمندي در زمينه بيولوژي مولكولي و ژنتيك برنج مي شود. براي مطالعه الگوي تفرق ژن آنتوسيانين ساقه تعداد 123 تك بوته از جمعيتF2 حاصل از تلاقي 18-33 -DN/ ندا A، مورد مطالعه قرار گرفت. تك بوته هايF2 بر اساس رنگ ساقه مورد ارزيابي و طبقه بندي قرار گرفتند. تعداد بوته هاي رنگي (ارغواني) 83 و تعداد بوته هاي بي رنگ 40 بوته مشاهده گرديد و نسبت تفرق 1 :075/2 بدست آمد. آماره c2 براي اين نسبت تفرق برابر با 48/3 بود كه اختلاف معني داري را از نسبت تفكيك 3:1 نشان نداد. اين نسبت مويد كنترل تك ژني براي صفت مذكور مي باشد. مطالعات مولكولي با استفاده از 59 نشانگر مولكولي SSR، 28 درصد پلي مورفيسم بين والدين را نشان دادند. آناليز لينكاژ انجام شده روي بوته هاي مغلوب جمعيت F2 نشان داد كه ژن آنتوسيانين ساقه روي بازوي كوتاه كروموزم شماره 6 برنج واقع بوده و با نشانگر RM253 همبسته مي باشد كه در فاصله 15 سانتي مورگان از ژن مورد نظر قرار دارد.

Anthocyanin pigments are responsible for production of purple stem in rice. Proper understanding of anthocyanin pigmentation may lead to the development of a powerful tool in rice genetics and molecular biology. Segregation mode of stem anthocyanin gene is studied on 123 individual plants from an F2 population derived from Neda/DN-33-18 cross. Plants evaluated based on stem color as purple and colorless classes. Segregating of 83 purple to 40 colorless plants revealed that monogenic Mendelian inheritance governed on this trait. Molecular analysis using 59 microsatellite markers showed that 17 (28%) were polymorphic between parents. Linkage analysis on recessive individuals from F2 population showed that the stem anthocyanin gene has associated with SSR marker RM253 located on short arm of chromosome 6 in rice genome.