بررسي تنوع ژنتيكي توده هاي بابونه (Matricaria aurea (Loefl.) Sch. Bip.) با استفاده از آغازگرهاي تصادفي و نيمه تصادفي

Study of Genetic Diversity in Chamomile Landraces (Matricaria aurea (Loefl.) Sch. Bip.) Using Random and Semi-Random Primers

بابونه يكي از مهمترين گياهان دارويي در عرصه تجارت جهاني است كه ناشي از كاربردهاي فراوان آن در صنايع دارويي و بهداشتي است. به منظور ارزيابي تنوع ژنتيكي توده هاي بومي بابونه با استفاده از آغازگرهاي تصادفي و نيمه تصادفي، 16 توده بومي بابونه متعلق به گونه Matricaria aurea (Loefl.) Sch. Bip. كه از نقاط مختلف كشور جمع آوري شده بود مورد استفاده قرار گرفت. 22 آغازگر تصادفي RAPD و 22 آغازگر نيمه تصادفي طراحي شده بر اساس مكان هاي هدف اينترون (IT) و اگزون (ET) با توالي هاي 15 و 18 جفت نوكليوتيدي مورد استفاده قرار گرفت. دامنه تعداد نوارهاي چند شكل توليدي توسط آغازگرهاي تصادفي بين 13-5 و توسط آغازگرهاي نيمه تصادفي بين 21-6 بود. براي تعيين تشابه بين توده هاي بومي از ضريب تشابه جاكارد استفاده شد و گروه بندي توده هاي بومي به روش UPGMA با استفاده از نرم افزار NTSYS انجام شد. تجزيه خوشه اي بر اساس هر دو گروه آغازگرها، توده هاي بابونه را به سه گروه تقسيم كرد. بر اساس ماتريس تشابه در هر دو گروه آغازگرها، توده تبريز كمترين ميزان تشابه را با ساير توده هاي بومي مورد مطالعه داشت. مقايسه آماري بين دو گروه آغازگر تصادفي و نيمه تصادفي نشان داد كه اختلاف معني داري بين دو گروه آغازگر از نظر تشكيل نوار و ايجاد چند شكلي وجود دارد. توانايي و كارآيي آغازگرهاي نيمه تصادفي در ايجاد چند شكلي از آغازگرهاي تصادفي بيشتر بود.

Chamomile is one of the important medicinal plants in commerce that has many applications in drug and sanitary industries. In order to evaluate the genetic diversity of different chamomile landraces (Matricaria aurea (Loefl.) Sch. Bip.) based on random and Semi-random primers, 16 landraces that collected from different areas of Iran were selected. Twenty-two random primers for RAPD marker and Twenty-two semi-random primers from IT (intron-targeting) and ET (exon-targeting) primers with 15-mer and 18-mer were used in this study. Genetic similarity between landraces was estimated using Jaccardʹs similarity coefficient. Cluster analysis was conducted with UPGMA method using NTSYS-pc ver 2.02 software. The number of polymorphic bands generated by random primers varied from 5-13 and varied from 6-21 for semi-random primers. According to the cluster analysis on both random and semi-random primers, 16 populations were classified into three groups. Based on similarity matrix, Tabriz landrace had minimum similarity with other landraces. Compare between random and semi-random primers showed that semi-random primers had more ability in produce polymorphism.