بررسي توالي ژن پروتيين پوششي جدايه‌هاي ايراني ويروس ايكس هوستا

Coat protein sequence analysis of Iranian Hosta virus X (HVX) isolates

در بهار سال 1390 طي بازديدي از مراكز توليد گياهان زينتي در شهرستان‌هاي كرج و تنكابن، تعدادي بوته هوستا (Hosta sieboldiana.) با علايم موزاييك، پيسك و بدشكلي برگ‌ها مشاهده شد. تعداد 17 بوته علايم‌دار انتخاب شد و احتمال آلودگي آنها به ويروس‌هاي موزاييك آرابيس (Arabis mosaic virus-ArMV)، موزاييك خيار (Cucumber mosaic virus-CMV)، پژمردگي لكه‌اي گوجه‌فرنگي (Tomato spotted wilt virus-TSWV)، لكه نكروز گل حنا (Impatiens necrotic spot virus-INSV) و لكه حلقوي گوجه فرنگي (Tomato ring spot virus-ToRSV) در آزمون سرولوژيك داس الايزا (DAS-ELISA) بررسي شد. نمونه‌هاي مورد بررسي با هيچ يك از آنتي‌بادي‌هاي اختصاصي ويروس‌هاي فوق‌الذكر واكنش نشان ندادند. مايه‌زني مكانيكي برخي از نمونه‌هاي علايم‌دار منجر به توليد لكه‌هاي نكروزه روي گل دكمه‌اي (Gomphrena globosa) و علايم سيستميك پيسك در Nicotiana bentamian گرديد. بررسي نمونه‌هاي هوستا با استفاده از روش مولكولي (RT-PCR) و آغازگرهاي اختصاصي طراحي شده در اين تحقيق براي تكثير ناحيه ژن پروتيين پوششي ويروس ايكس هوستا (Hosta virus X-HVX)، منجر به توليد قطعه دي.ان.اي به طول تقريبي 700 جفت باز گرديد. مقايسه توالي ژن پروتيين پوششي پنج جدايه ايراني HVX با 55 توالي موجود در بانك ژن حاكي از وجود درصد بالاي يكنواختي (5/98 تا 5/99%) در سطح توالي نوكليوتيدي بين آن‌ها بود. كمترين يكنواختي توالي (5/98 درصد) بين جدايه ايراني HVX.Ir.TnK2 با جدايه AJ620114 از كره جنوبي تعيين گرديد. اين اولين گزارش از وقوع ويروس ايكس هوستا در ايران است و توالي نوكليوتيدي ژن پروتيين پوششي جدايه‌هاي ايراني HVX براي اولين بار در اين تحقيق تعيين و مقايسه شد.

During the spring of 2011, several symptomatic hosta plants Hosta sieboldiana with mosaic, mottling and leaf deformation were observed in commercial hosta propagation greenhouses and gardens in Karaj and Tonekabon regions in Iran,. A total of 17 symptomatic samples were collected and tested for the presence of Arabis mosaic virus-ArMV, Cucumber mosaic virus-CMV, Tomato spotted wilt virus-TSWV, Impatiens necrotic spot virus-INSV and Tomato ring spot virus-ToRSV by DAS-ELISA method. None of the tested samples had positive reaction with any of the antibodies. Some of symptomatic samples induced necrotic local lesions on Gomphrena globosa indicator plant in mechanical inoculations without inducing any symptom on other inoculated plants. Samples were tested for Hosta virus X (HVX) infection by reverse transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR) using specific primers designed for coat protein (CP) gene in this study and a DNA fragment with the expected size about 700 bp was amplified. CP sequences of Iranian HVX isolates showed 98.5 – 99.5 % nucleotide identity with 55 other non-Iranian HVX isolates. This is the first report of HVX occurrence in Iran and CP nucleotide sequence of five Iranian HVX isolates was determined.