مطالعه تنوع سويه‌اي اكينوكوكوس گرانولوزوس با تكثير ژن co-1 به روش PCR-RFLP در استان آذربايجان غربي

A STUDY ON ECHINOCOCCUS GRANULOSUS STRAINS USING NUCLEOTIDE SEQUENCE OF CO-1 GENE BY PCR-RFLP TWCHNIQUE IN WEST AZARBAIJAN PROVINCE, IRAN.

پيش زمينه و هدف: شناسايي تنوع ژنوتيپي گونه‌هاي اكينوكوكوس گرانولوزوس از نظر همه گيري شناسي و كنترل عفونت‌هاي ناشي از نوزاد اين سستود در مناطق بومي اهميت زيادي دارد. تحقيق حاضر نيز به منظور شناسايي و تعيين سويه‌هاي اكينوكوكوس گرانولوزوس در نشخواركنندگان استان آذربايجان غربي انجام شد. مواد و روش كار: اندام‌هاي نشخواركنندگان داراي كيست‌هاي هيداتيد شامل 115 كبد و 155 ريه گوسفند، 59 كبد و 126 ريه بز، 119 كبد و 78 ريه گاو و 129 كبد گاوميش از كشتارگاه‌هاي شهرستان‌هاي خوي در شمال، اروميه در مركز و مهاباد در جنوب استان آذربايجان غربي جمع آوري گرديدند. پس از ضدعفوني نمودن سطح هر كيست، مايع داخل كيست‌ها جمع آوري و جهت جداسازي پروتواسكولكس ها سانتريفوژ گرديدند. از تعداد 114 كبد و ريه آلوده به كيست هيداتيد بارور، دي ان آ استخراج شد. تنوع سويه‌اي سستود، با تكثير قطعه bp 1213 ژن سيتوكروم اكسيداز تحت واحد 1 انجام شد و الگوي آر اف ال پي آن‌ها توسط آنزيم HaeIII ارزيابي گرديد. يافته‌ها: يافته‌هاي مولكولي نشان داد كه قطعه تكثير شده ژن سيتوكروم اكسيداز پروتواسكولكس هاي جمع آوري شده از كبد و ريه نشخواركنندگان اهلي داراي اندازه يكسان بودند. الگوي هضم آنزيمي جدايه هاي گوسفند، بز و گاو مشابه بودند ولي الگوي هضم آنزيمي براي گاوميش متفاوت بود. بحث و نتيجه گيري: الگوي بدست آمده از هضم آنزيمي محصولات واكنش زنجيره‌اي پلي مراز ژن مورد مطالعه نشان داد كه دو سويه گوسفندي (G1) و گاوميش (G3) اكينوكوكوس گرانولوزوس همزمان در شمال غرب ايران حضور دارند.

Background & Aims : Identification of genotypic variation of Echinococcus granulosus strains is important for epidemiology and control of the larval stage of this parasite. The present study was undertaken in order to identify E. granulosus strains in West Azerbaijan province , Iran . Materials & Methods : Organs infected with hydatid cysts from slaughtered ruminants including 115 liver and 155 lungs from sheep, 59 liver and 126 lungs from goats, 119 liver and 78 lungs from cattle and 129 livers from water buffalos were obtained from slaughterhouses of Khoy (north), Urmia (central), and Mahabad (south). After disinfection of each cyst surface, hydatid cyst fluid was aspirated and centrifuged for collecting protoscolices . A number of 114 fertile hydatid cysts were used for DNA extraction. To determine genotypic variation of E. granulosus, a fragment of 1213 bp of mitochondrial cytochrom oxidase subunit 1 (co-1) gene was amplified (PCR). Obtained PCR products were subjected to restriction fragment length polymorphism (RFLP) analysis using HaeIII endonuclease . Results : A fragment of 1213 bp in size of co-1 gene was amplified successfully form all hydatid cysts of examined ruminants. Amplified PCR products from hydatid cysts of cattle, sheep, and goats generated similar RFLP patterns, but different RFLP pattern for hydatid cysts from buffaloes. Conclusion : The RFLP patterns of the amplified fragment of the co-1 gene of E. granulosus indicated the circulation of two different E. granolusus strains of sheep (G1) and water buffalo (G3) in northwestern of Iran .