مقايسه دو روش ژنوتيپي بيان ژنmexX و فنوتيپي حداقل تراكم بازدارندگي در سويه هاي باليني سودوموناس ايروژنزا

Comparison of genotypic method of mexX gene expression and phenotypic method of minimum inhibitory concentration in clinical isolates of Pseudomonas aeruginosa

زمينه: فعاليت پمپ MexXY-OprM باعث مقاومت ذاتي به عوامل ضد ميكروبي متعدد در سويه هاي سودوموناس ايروژنزا جدا شده از بيماران مي شود. بررسي بيان ژن هاي كدكننده اجزاي پمپ MexXY-OprM نظير mexX با روش Real time PCR مي تواند در انتخاب درمان مناسب آنتي بيوتيكي كمك كند. هدف: مطالعه به منظور مقايسه دو روش ژنوتيپي بيان ژن mexX و فنوتيپي حداقل تراكم بازدارندگي در سويه هاي باليني سودوموناس ايروژنزا انجام شد. مواد و روش ها: اين مطالعه توصيفي آزمايشگاهي در سال 1390 در دانشگاه كاتوليك لوين انجام شد. پس از استخراج RNA از 16 سويه باليني و ساختن cDNA، سطح بيان ژن mexX با روش Real time PCR و كيت mexQ-TesT تعيين شد. طبق دستور كار كيت كه مبتني بر محاسبه آماري تي با حدود اطمينان %95 و 05/0P < است، سطح بيان 5 و بالاتر به عنوان بيش بيان در نظر گرفته شد. يافته ها: از 11 سويه باليني با افزايش حداقل تراكم بازدارندگي براي آمينوگليكوزيدها، تنها 7 سويه بيش بيان ژن mexX را نشان دادند. هيچ ارتباط مستقيمي ميان مقدار بيان پمپ با مقدار افزايش حداقل تراكم بازدارندگي براي آنتي بيوتيك هاي مختلف مشاهده نشد. نتيجه گيري: با توجه به اين كه نتايج بيان ژن با داده هاي مقاومت آنتي بيوتيكي در همه موارد همخواني نشان نداد، استفاده همزمان از دو روش ژنوتيپي و فنوتيپي توصيه مي شود.

Background: The MexXY-OprM efflux pump contributes to the intrinsic resistance to various antimicrobial agents in Pseudomonas aeruginosa isolated from patients. Detection of the expression of genes encoding components of the MexXY-OprM efflux pump such as mexX using real time polymerase chain reaction (PCR) can be helpful in selecting suitable antibiotic treatment. Objective: The aim of this study was to compare the genotypic method of mexX gene expression and the phenotypic method of minimum inhibitory concentration in clinical isolates of Pseudomonas aeruginosa. Methods: This descriptive-laboratory study was conducted in University of Catholique de Louvain in 2012. After RNA extraction from 16 clinical isolates and cDNA synthesis, expression of mexX was detected by real time PCR using P. aeruginosa mex Q-TesT. According to the mex Q-TesT guideline, which is based on student T-test with 95% confidence interval and P < 0.05, values equal or greater than 5 were considered as overexpression. Findings: Only 7 out of 11 clinical isolates with increased minimum inhibitory concentration for aminoglycosides showed overexpression of mexX. There was not any relationship between the pump expression and the increase in minimum inhibitory concentration values for various antibiotics. Conclusion: Since the results of the gene expression and the antimicrobial resistance data are not consistent in all cases, simultaneous use of both genotypic and phenotypic methods is recommended.