بررسي تنوع وراثتي ارقام زراعي و گونه هاي خودروي جنس Crocusبا استفاده از نشانگر ISSR در ايران

Genetic Diversity of Cultivated and Wild Crocus genus in Iran with ISSR Markers

جنس Crocus شامل تقريبا هشتاد گونه است كه عمدتاً توسط گونه زراعي آن Crocus sativus شناخته مي شود. تنوع ژنتيكي ميان 16 نژادگان جنس فوق در ايران براي اولين بار توسط نشانگر ISSR مورد مطالعه قرار گرفت. چهارده نشانگر، در مجموع 208 قطعه قابل تشخيص و تكرار پذير توليد كردند كه تمام قطعات چند شكل بودند. قطعات ايجاد شده بر اساس وجود و عدم وجود امتياز دهي شدند و از داده هاي فوق براي محاسبه ضرايب شباهت دايس، جاكارد و تطابق ساده استفاده گرديد. دندروگرام مربوطه توسط نرم افزار NTSYSpc (نسخه 02/2) و بر اساس الگوريتم Complete Linkageو UPGMA ترسيم گرديد. تجزيه و تحليل خوشه اي، نژادگان را به پنج گروه اصلي تقسيم نمود. علاوه بر اين، نمودارهاي به دست آمده از تحليل PCoA نيز نژادگان را به پنج گروه تفكيك مي نمايد. قدرت تفكيك تجمعي برابر با 134، ميزان كمينه قدرت تفكيك برابر با 87/4 در آغازگر UBC872 و ميزان بيشينه برابر با 5/15 در آغازگر UBC851و متوسط قدرت تفكيك برابر با 6/9 مي باشد. نتايج به دست آمده سودمندي بالاي نشانگر هاي ISSR را براي گروه بندي گونه هاي Crocus و تحليل روابط زنتيكي آنها را نشان مي دهد.

The Crocus genus, which comprehends approximately 80 species, is known mainly for the cultivated species Crocus sativus. Genetic variability among 16 genotype of Crocus genus originating from Iran was examined for the first time with Inter Simple Sequence Repeat (ISSR). Fourteen primers generated a total of 208 discernible and reproducible bands across the analyzed populations, that all of these showed polymorphism. The fragment scored for presence/absence and used to generate Dice, Jaccard and Simple Maching similarity coefficients and to construct a dendrogram by means of UPGMA and Complete Linkage in NTSYS-pc 2.02 computer program. Cluster analysis revealed primarily five major groups. Furthermore, dimensional graph derived from Principal Coordinate Analysis (PCoA) of ISSR data also revealed a pattern in which the genotypes were assigned into five separate groups. Estimation of Resolving Power (RP) values exhibited a collective rate of 134.08 and varied from 4.87 for UBC 872 to 15.5 for UBC 851 with a mean of 9.6. The results showed the high effectiveness of ISSR markers in grouping of Crocus species under study, and analysis of their genetic relationships.