پيش بيني و بررسي نقش پلي مورفيسم ژن SOCS1 در بيماريزايي مالتيپل اسكلروزيس با تغيير محل اتصال ميكرو RNA ها

The prediction and analysis of SOCS1 SNPs in the pathogenesis of Multiple Sclerosis with the alternation of some MicroRNAs binding sites

زمينه و هدف: بيماري مالتيپل اسكلروزيس (ام اس) يك بيماري تخريب كننده ميلين در سيستم عصبي مركزي مي باشد كه سبب شناسي ناشناخته اي دارد. شيوع ام اس در جهان و از جمله ايران افزايش يافته است. ارتباط ژن SOCS1 (Suppressor of Cytokine Signaling) با بيماري ام اس بواسطه اسنيپ 243324 rs در چندين مطالعه بررسي و مورد تاييد قرار گرفته است. با ورود ميكرو RNA ها (miRNAs) به دنياي يافته هاي ژنتيكي، نقش آنها در بيماري ام اس مورد ارزيابي واقع شده است. از آنجا كه miRNA ها واحدهاي عملكردي كوچكي هستند، تغييرات تك نوكليوتيدي در توالي پيش سازها، فرم بالغ و همچنين در توالي هدف آنها ممكن است باعث تغيير در عملكرد بيولوژيك آنها شود. مواد و روش كار: در اين مطالعه، توالي اسنيپ 243324 rs از پايگاه اينترنتي NCBI دريافت گرديد. با كمك پايگاه اينترنتي miRBase همولوژي موجود در توالي جايگاه اسنيپ در دو حالت وجود و عدم وجود آلل خطر با miRNA هاي مختلف مورد آناليز واقع گرديد. يافته ها: بررسي هاي انجام شده نشان مي دهند كه توالي شامل اسنيپ 243324 rs در ناحيه 5’-UTR ژن SOCS1 با توالي ميكرو RNA هاي hsa-miR-4732-5p، hsa-miR-3976، hsa-miR-4727-3p و hsa-miR-4793-5p همولوژي دارد و اين همولوژي با تغيير آلل C به T در محل اسنيپ تحت تاثير قرار مي گيرد. نتيجه گيري: تغيير ايجاد شده بواسطه اسنيپ 243324 rs مي تواند تغييري بالقوه در جايگاه اتصال چند ميكروRNA ايجاد كند و پيش بيني مي شود با تغيير در ميزان بيان ژن SOCS1 در بيماريزايي ام اس موثر باشد كه بررسي آن پيشنهاد مي گردد. در صورت تاييد نقش miRNA هاي ذكر شده بر بيان ژن SOCS1، اين ژن مي تواند در كنار داروهاي در دسترس براي ام اس، هدفي براي توسعه روش هاي جديد درماني باشد.

Background & objectives: Multiple Sclerosis (MS) is a neurodegenerative disease in the central nervous system with an unknown etiology. The prevalence of MS increased worldwide including Iran. The association of rs243324 SNP of SOCS1 gene with MS was evaluated by Vandenbroeck. Also many studies evaluated the role of miRNAs in the pathogenesis of MS. Since miRNAs are small functional units, single base changes in the precursor elements, the mature miRNA sequence and their target gene sequences may drive alteration in their biological function. Material & Methods: In this study, the sequence of rs243324 SNP obtained from NCBI database. The analysis of the sequence of SNP in the presence and absence of the risk allele evaluated via miRBase algorithm. Results: Our results revealed that, the sequence of rs243324 SNP is homologous with the sequence of some miRNAs including: hsa-miR-4732-5p, hsa-miR-3976, hsa-miR-4727-3p and hsa-miR-4793-5p and can change their binding sites and this homology affected by alternation of C to T allele of SNP Conclusion: miRNAs regulate the gene expression at the post-transcriptional level by repression or degradation of their mRNA targets. rs243324 SNP can change the binding sites of some miRNAs and may be effective in the pathogenesis of MS through the change of SOCS1 expression. After demonstration in expression level, SOCS1 can be proposed as a new potential therapeutic target for MS.