اثر جايگاه ژنتيكي عامل نكروز تومور آلفا بر صفات بيومتري در گوسفندان ماكويي

Effect of tumor necrosis factor alpha locus on biometric traits of Makoei sheep

عامل نكروز تومور آلفا(TNF?) يك سيتوكين پيش التهابي است كه در تنظيم پاسخ ايمني از جمله فعاليت ماكروفاژ ها و مرگ سلولي از اهميت ويژه اي برخوردار است. مطالعه حاضر، جهت ارزيابي چندشكلي ژن TNF? گوسفند ماكويي و ارتباط آن با صفات بيومتري انجام شد. DNA ژنومي از خون 90 راس گوسفند استخراج شد. يك قطعه 273 جفت بازي از ناحيه اگزون 4 و ناحيه غير كد شونده ´3 (3´ UTR)، توسط PCR استاندارد و با استفاده از آغازگر هاي مخصوص اين جايگاه ژني، تكثير شد. سپس بررسي چندشكلي فرم فضايي رشته هاي منفرد (SSCP) محصولات PCR توسط ژل پلي آكريلاميد 8 درصد و رنگ آميزي نيترات نقره انجام شد. در نهايت سه ژنوتيپ EE، OE و RE به ترتيب با فراواني-هاي 4667/0، 3556/0 و 1777/0 مشاهده شدند. فراواني آلل هاي E، O و R به ترتيب7333/0، 1778/0 و 0889/0 محاسبه شد. آزمون مربع كاي، انحراف معني داري از تعادل هاردي- واينبرگ را براي اين جايگاه ژني در جمعيت مورد مطالعه نشان داد (05/0 > P). ارزيابي ارتباط بين ژنوتيپ ها با طول بدن، دور سينه، ارتفاع از جدوگاه، ارتفاع از پشت و دور ران توسط رويه GLM نرم افزار SAS، ارتباط معني داري را بين ژنوتيپ هاي TNF? با دور ران نشان دادند (05/0 > P). دام هاي داراي ژنوتيپ EE دور ران بالاتري (6/0± 76/35 سانتي متر) در مقايسه با ژنوتيپ هاي ديگر داشتند. نتايج نشان مي دهد كه چندشكلي در ژن TNF? داراي اين پتانسيل است كه به عنوان نشانگر ژنتيكي براي بهبود صفات مرتبط با رشد در برنامه هاي اصلاح نژادي گوسفند باشد. مطالعات بيشتري با نشانگر ها و نژاد هاي مختلف جهت آشكار كردن ماهيت ژنتيكي تاثيرات ايمني روي صفات رشد، مورد نياز است.

Tumor Necrosis Factor Alpha (TNF?) is a proinflammatory cytokine that plays critical roles in the regulation of immune responses including macrophages activity and apoptosis. In the present study, polymorphism of TNF? gene in Makoei sheep was investigated and its association with biometric traits was analyzed. Genomic DNA of 90 sheep was extracted from blood. A 273bp fragment in the regions of the exon 4 and 3´ un-translated region (3´ UTR) was amplified by standard PCR, using locus-specific primer. The single stranded conformation polymorphism (SSCP) of PCR products were studied using 8% Polyacrilamid gel and silver staining method. Finally, three genotypes EE, OE and RE were obtained with frequencies of 0.4667, 0.3556 and 0.1777, respectively. The frequencies of E, O and R alleles were calculated as 0.7333, 0.1778 and 0.0889, respectively. The chi-square test showed significant deviation from Hardy-Weinberg equilibrium for this locus in studied population (P < 0.05). The evaluation of association between genotypes with body length, heart girth, height at withers, height at back and leg girth using a GLM procedure of SAS program, showed a significant association between TNF? genotypes with leg girth (P < 0.05). The genotype of EE had a superior leg girth (35.76±0.6 cm) than the other genotypes. These results suggest that polymorphism at TNF? gene may be as a potential genetic marker to improve growth related traits in sheep breeding programs. Further studies with various markers and breeds will be needed in order to clarify the genetic background for immunological influences on growth traits.