بررسي ساختار ژنتيكي سگ هاي بومي ايران با استفاده از اطلاعات ژنوم ميتوكندري

Study of the Genetic Structure of Iranian Native dogs Using Mitochondrial DNA information

هدف تحقيق حاضر مطالعه ساختار ژنتيكي سگ هاي بومي ايران و مقايسه با ديگر نژادهاي خارجي است. براي اين منظور نمونه هاي خون از 93 قلاده سگ از جمعيت هاي مختلف، از نقاط مختلف كشور جمع آوري گرديد، همچنين به منظور مقايسه نتايج حاصل با ديگر نژادهاي آسيايي و اروپايي، 655 توالي 582 جفت بازي از ناحيه كنترل ژنوم ميتوكندري از بانك اطلاعات ژنوم دريافت شد. استخراج DNA كليه نمونه هاي خون صورت گرفت و براي تكثير و تعيين توالي ناحيه كنترل ژنوم ميتوكندري استفاده شد. با مطالعه توالي 582 جفت بازي ناحيه كنترل ژنوم ميتوكندري، 25 هاپلوتيپ تشخيص داده شد. مقدار تنوع نوكليوتيدي كل براي سگ هاي بومي ايران 00704/0±01354/0 بدست آمد. نتايج آناليز واريانس مولكولي با استفاده از روش F-Statistics مقدار معني داري را نشان داد (029/0=Fst و 000/0=P). مقادير شاخص تثبيت با استفاده از اين روش داراي دامنه اي بين 02671/0- الي 37481/0 بودند. بر اساس اين آزمون برخي از اين جمعيت ها بخصوص جمعيت تازي با جمعيت هاي سرابي، بختياري، بومي البرز و بومي غرب كشور، جمعيت سرابي با جمعيت هاي كردي، سنگسري، البرز و بومي غرب كشور، جمعيت بختياري با جمعيت هاي بومي البرز و بومي غرب كشور و جمعيت اروپا با غرب آسيا با يكديگر از نظر ژنتيكي متفاوت بودند (05/0 > P). همچنين جمعيت هاي تازي، سرابي و بومي غرب كشور با نژادهاي اروپا و غرب آسيا اختلاف معني داري نشان دادند (05/0 > P). جمعيت سگ هاي بومي خراسان با همه جمعيت هاي مورد بررسي شباهت ژنتيكي نشان داد (05/0 < P). به طوركلي نتايج بدست آمده در اين مطالعه نشان دهنده تنوع ژنتيكي قابل قبول و وجود شباهت ژنتيكي در برخي از جمعيت هاي مورد مطالعه مي باشد.

The objective of the current study was analysis of the genetic structure of Iranian native dogs in comparison with the exotic breeds. To follow this, blood samples of 93 dogs were obtained from diverse areas of Iran and, in addition, 655 sequences of canine D-loop region obtained from GenBank. Total DNA of the samples were extracted by salting out procedure and applied as template for amplification and sequencing of the D-loop region of mtDNA. Sequence analysis of the 582-bp D-loop region of mtDNA in all samples defined a total of 25 haplotypes. The total nucleotide diversity was 0.01354± 0.00704 for Iranian native dogs. Analysis of molecular variance (AMOVA) showed significant percent for the variance between the studied populations (?ST=0.029, P=0.0000). Fixation index values using F-Statistics method ranged from -0.02671 to 0.3748. Analysis of molecular variance displayed significant difference between some of these populations. The variation was especially observed between Tazi and Sarabi, Bakhtiari, Alborz native and Western regions populations or between Sarabi population with Kurdi, Sangsari, Alborz native and Western regions populations. Bakhtiari population showed a significant difference (P > 0.05) with Alborz native and Western regions populations, and finally European breeds exhibited a difference with South West Asia breeds. In addition Tazi, Sangsari and Western regions populations displayed significant difference with European breeds and South West Asia breeds (P > 0.05). Overall, the results of this study showed an acceptable genetic variation and genetic similarity in some Iranian dog populations.