ارزيابي فواصل ژنتيكي ارقام برنج با استفاده از نشانگرهاي RAPD

Evaluation of Genetic Distances of Rice Varieties using RAPD Markers

در برنامه هاي اصلاحي برنج از طريق هيبريداسيون براي توليد لاين‌هاي جديد، اطلاع از فواصل و تشابهات ژنتيكي بين ارقام امري ضروري مي‌باشد. اين مطالعه با هدف ارزيابي فواصل ژنتيكي شانزده رقم برنج با استفاده از تجزيه و تحليل RAPD انجام شده است. از 15 آغازگر مورد استفاده 8 آغازگر توليد چند‌شكلي نمودند و تعداد باندهاي توليد شده توسط هر آغازگر از 4 (OPB-04) تا 11 (OPD-11) با متوسط 75/7 باند براي هر آغازگر متغير بود. از مجموع 62 باند، 43 باند (35/69%) چندشكلي بين ارقام را نشان دادند. تجزيه و تحليل خوشه اي در معيار فاصله ژنتيكي 15، ارقام مورد مطالعه را در 5 خوشه گروه‌بندي نمود. نتايج اين مطالعه نشان داد كه ارقام هاشمي و پويا بيشترين فاصله ژنتيكي را از همديگر و نيز نسبت به ساير ارقام داشتند. اطلاعات بدست آمده در اين تحقيق براي انتخاب والدين متفاوت از نظر ژنتيكي در برنامه-هاي آتي اصلاح برنج در ايران مفيد خواهد بود.

In rice breeding programs through hybridization, information on genetic distances and similarities between varieties is necessary for development of new lines. This study conducted with the aim of evaluating genetic distances between sixteen rice varieties using Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) analysis. Eight out of fifteen primers generated polymorphism and the number of amplification products generated by each primer varied from 4 (OPB-04) to 11 (OPD-11) with an average of 7.75 bands per primer. Out of 62 bands, 43 (69.35 percent) were found to be polymorphic between varieties. Cluster analysis grouped genotypes into 5 clusters. Results of the study showed that varieties Hashemi and Pouya had more genetic distance from each other and from the rest varieties. The information obtained in this study will be helpful in selecting genetically diverse parents for designing rice breeding program in Iran.