ارتباط پلي مورفيسم T > C (rs1635498) ژن اگزونوكلياز1 و ريسك ابتلا به سرطان روده بزرگ غير ارثي در يك جمعيت از ايران

THE ASSOCIATION BETWEEN EXONUCLEASE1 GENE POLYMORPHISM T > C (RS1635498) AND RISK OF SPORADIC COLORECTAL CANCER IN AN IRANIAN POPULATION

چكيده پيش زمينه و هدف: يكي از سيستم‌هاي مهم تعمير DNA ، سيستم ترميم جفت بازهاي ناجور (MMR) است. موتاسيون در اين سيستم مي‌تواند منجر به انواع مختلف سرطان شود. اگزونوكلياز1 (Exo1) تنها اگزونوكلياز درگير در سيستم MMR انساني است. به دليل نقش خاص Exo1 در سيستم MMR ،اين ژن يك فاكتور مستعد كننده در سرطان كلوركتال محسوب مي‌شود. چند شكلي‌هاي تك نوكليوتيدي ((SNP در افزايش يا كاهش ميزان ابتلا به سرطان كلوركتال دخيل هستند. در اين مطالعه، به‌منظور دستيابي به بيوماركرهاي مستعد كننده سرطان كلوركتال، به بررسي همبستگي پلي‌مورفيسم تك نوكليوتيدي rs1635498 (C723R) ژن Exo1 و احتمال خطر ابتلا به سرطان روده بزرگ در بيماران مراجعه كننده به بيمارستان طالقاني تهران مي‌پردازيم. مواد و روش كار: اين مطالعه مورد-شاهدي بر روي 111 بيمار مبتلا به سرطان كلوركتال و 121 فرد سالم كه به بيمارستان طالقاني شهر تهران مراجعه كرده بودند انجام گرفت. جهت تعيين ژنوتيپ‌هاي پلي‌مورفيسم تك نوكليوتيديrs1635498 ژن Exo1 از روش PCR-RFLP و آنزيم محدودالاثر HpyCHIV مورد استفاده قرار گرفت. يافته‌ها: بر اساس يافته‌ها در حالتي كه ژنوتيپ TT به‌عنوان مرجع انتخاب شد، درصد فراواني ژنوتيپ‌هاي CC,CT,TT در بيماران مبتلا به سرطان كلوركتال 1/90 ،0/9 ، 9/0 درصد و در گروه كنترل 6/92 ،4/7 ،0/0 درصد بوده و اختلاف معني‌دار نشان ندادند. درصد فراواني آلل T در نمونه‌هاي بيمار، 6/94 درصد و در گروه كنترل 3/96 درصد بود. همچنين درصد فراواني الل C در نمونه‌هاي بيمار و كنترل به‌ترتيب، 4/5درصد و 7/3 درصد محاسبه شد. بحث و نتيجه گيري: نتايج نشان داد كه پلي‌مورفيسم rs1635498 ژن Exo1 با مستعد كردن افراد در ابتلا به سرطان كلوركتال همبستگي نداشته و بنابراين مي‌توان نتيجه‌گيري كرد كه اين پلي‌مورفيسم در افزايش يا كاهش خطر ابتلا به سرطان كلوركتال نقش معناداري ندارد.

THE ASSOCIATION BETWEEN EXONUCLEASE1 GENE POLYMORPHISM T > C (RS1635498) AND RISK OF SPORADIC COLORECTAL CANCER IN AN IRANIAN POPULATION Zahra Akbari , , Seyed Reza Mohebi *, Mohammad Yahgoob Taleghani , Mahdi. Montazer Haghighi , Mohsen Vahedi , Hanie Mir Talebi , Pedram Azimzadeh , Sara Romani , Mohammad Reza Zali Received: 22 May , 2013; Accepted: 11 Sep , 2013 Abstract: Background & Aim: One of the important DNA repair systems is Mismatch Repair (MMR). Mutation in this system can cause different types of cancer. Exonuclease1 (Exo1) is the only exonuclease involved in the human MMR system. Since Exo1 plays a distinctive role in the MMR system, this gene has gained a great intrest as a potential risk factor in Colorectal Cancer (CRC). Single nucleotide polymorphisms (SNP) involve in increasing or decreasing the risk of CRC. In this study, to find a potential biomarker of CRC, we investigated the association between SNP of Exo1 gene, rs1635498, and risk of colorectal cancer in patients who had referred to Taleghani hospital. Materials & Methods: This case-control study was performed on 111 cases and 121 healthy controls who had been registered in Taleghani hospital of Tehran. Genotyping analysis was performed by polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) and use HPYCHVI restriction enzyme. Result: According to our finding, while TT genotype was selected as a refrence, the frequency percent of TT, CT and CC genotypes in the patients were %90.1, %9.0, %0.9 and in the control group were %92.6, %7.4 and %0.0. We observed no significant difference. The frequency percent of T allele in the patients was %94.6 and in the controls were %96.3. Also the frequency percent of C allele were calculated in the patients and controls group respectively %5.4 and %3.7. Conclusions: The findings indicated that rs1635498 polymorphism in Exo1 gene isnʹt associated with susceptibility to CRC. So, we conclude that this polymorphism doesn’t have significant role in incresing or decreasing risk of CRC. Keywords: SNP, Colorectal cancer (CRC), Exonuclease1 gene