مطالعه تنوع ژنتيكي پاتوتيپ‌هاي Puccinia triticina عامل زنگ قهوه‌اي گندم ايران بر اساس توالي يابي ناحيه rDNA IGS1 *

STUDY OF GENETIC DIVERSITY OF Puccinia triticina PATHOTYPES, THE CAUSAL AGENT OF WHEAT LEAF RUST IN IRAN BASED ON RDNA IGS1 SEQUENCING

فنوتيپي و پاتوتيپي گرديدند و ناحيه IGS1 rDNA توالي‌يابي شد. در رابطه با كليه جدايه‌ها يك محصول PCR با اندازه 870 جفت بازي به دست آمد. هم‌رديف سازي توالي‌هاي IGS1 مربوط به جدايه‌هاي مورد بررسي نمايانگر 2/1-0 درصد تفاوت بين آنها بود كه بيانگر توالي‌هاي بسيار مشابه در اين ناحيه است. با ترسيم درخت فيلوژنتيك بدون ريشه، به روش پيوست همسايهها، جدايههاي مورد بررسي در شش گروه متمايز قرار گرفتند. نتايج نشان داد كه ارتباط مستقيمي بين پاتوتيپ‌هاي شناسايي شده و گروه‌بندي حاصل از توالي‌‌يابي ناحيه IGS1 وجود ندارد.

To identify pathotypes, phenotypes and genetic diversity of Iranian wheat leaf (brown) rust (Puccinia triticina) isolates, eleven samples were collected from different geographical regions. Pathotype and phenotype of each isolate was identified and the intergenic spacer of rDNA (IGS1) wassequenced . One PCR product (870 bp) was recovered from all isolates. Multiple sequence alignments showed 0.0 to1.2 % difference indicating that IGS1 sequences were highly conserved among all analyzed isolates. The unrooted phylogenetic tree of sequences was drawn based on neighbor joining (NJ) procedures. Based on NJ tree, all sequences were grouped into six different clades. The results showed no direct relationship between P. triticina pathotypes and rDNA IGS1 sequence differences.