عنوان مقاله :
پليمورفيسم ژني سويه واكسن BCG مورد استفاده در ايران
عنوان فرعي :
Gene polymorphism of BCG vaccine strain using in Iran
پديد آورندگان :
فلاح ، فاطمه نويسنده "گروه ميكروبشناسي، دانشكده پزشكي" و "مركز تحقيقات عفوني اطفال"، دانشگاه علوم پزشكي شهيد بهشتي، تهران، ايران Fallah , F , گودرزي ، حسين نويسنده گروه ميكروبشناسي، دانشكده پزشكي، دانشگاه علوم پزشكي شهيد بهشتي، تهران، ايران Goudarzi , H , دوستدار، فرحنوش نويسنده گروه ميكروبشناسي، دانشكده پزشكي، دانشگاه علوم پزشكي شهيد بهشتي، تهران، ايران Doustdar , F , زهرايي ، سيد محسن نويسنده مركز مديريت بيماريهاي واگير، وزارت بهداشت، درمان و آموزش پزشكي، تهران، ايران Zahraei , S. M , محمدزاده، عليرضا نويسنده گروه ميكروبشناسي، دانشكده پزشكي، دانشگاه علوم پزشكي شهيد بهشتي، تهران، ايران Mohammadzadeh, A. R
اطلاعات موجودي :
فصلنامه سال 1392 شماره 59
كليدواژه :
MIRU-VNTR تايپينگ , واكنش پليمرازي زنجيرهاي , BCG Vaccine , Gene Polymorphism , PCR , واكسن BCG , پليمورفيسم ژني , MIRU-VNTR Typing
چكيده فارسي :
اهداف: باسيل كالمت-گرين (BCG) تنها واكسن در دسترس عليه بيماري سل است. سويه BCG مورد استفاده بهعنوان واكسن در ايران نامشخص است. هدف اين مطالعه تاييد و كنترل كيفي واكسن BCG مورد استفاده در ايران و تعيين پليمورفيسم ژني اين سويه بود.
روشها: 28 واكسن BCG ليوفليزه (انيستيتو پاستور؛ ايران) با شماره سريالهاي متفاوت طي يك سال (91-1390) جمعآوري و تحت شرايط دمايي °C4 به آزمايشگاه انتقال داده شدند. از هر شماره سريال 3 سويه واكسن بهصورت تصادفي انتخاب شد. استخراج DNA با روش CTAB انجام شد. نمونههاي DNA در دماي °C20- نگهداري شدند. از 4 پرايمر براي PCR ژنهاي RD14 و DU1 استفاده شد. تعيين توالي ناحيه RD16 در سويههاي واكسن BCG توسط DNAآنالايزر ABI3730XL با نرمافزارهاي Chromas و Mega 4 انجام شد. VNTR تايپينگ براي 6 جايگاه ژني صورت گرفت.
يافتهها: تمام سويهها از نظر كشت روي محيط مثبت بودند. در همه سويههاي BCG مورد بررسي مضاعفشدگي DU1 در كروموزوم باكتريها مشاهده شد. هيچكدام از سويهها داراي ژن RD14 نبودند. همه نواحي RD16 داراي توالي مشابه با ناحيه RD16 در ژنوم سويه Pasture1173p2 بودند. تعداد و اندازه واحدهاي تكراري براي 6 جايگاه ژني MIRU4، MIRU24، MIRU26، MIRU40، VNTR1895 و VNTR11b در 28 سويه BCG مختلف در نمونههاي واكسن بهترتيب 122+(77*2)، 393+(54*2)، 285+(51*5)، 354+(54*2)، 281+(57*4) و 67+(69*3) بود.
نتيجهگيري: سويه BCG مورد استفاده در ايران، همان سويه Pasture1173p2 است و ميتوان از آن به عنوان واكسن استفاده نمود.
چكيده لاتين :
Aims: The Bacille Calmette-Guérin (BCG) is the only vaccine available against tuberculosis. The BCG strain used in Iran as the vaccine is not specified. The purpose of the present study was to confirm and make a qualitative control for BCG vaccine in Iran and to determine the genetic polymorphism of the given strain.
Methods: Twenty eight lyophilized BCG vaccines (Pasteur Institute, Iran) with different batch numbers were collected over a year (2011-12) and transferred under the temperature condition of 4°C to the laboratory. Three strains of vaccine were selected randomly out of each batch number. The DNA was extracted using CTAB method. DNA samples were kept at -20°C. Of four primers, RD14 and DU1 genes were used for PCR. The sequence of RD16 region in BCG strains was determined using DNA analyzer ABI3730XL using Chromas and Mega4 software. VNTR typing was done for six genic positions.
Results: All strains were positive in terms of their culture on the medium. In all BCG strains under study, DU1 duplication in the bacteria’s chromosome was observed. None of strains had RD14 gene. All RD16 regions had similar sequence with RD16 region in the genome of Pasture1173p2 strain. The number and size of repeated units for six gene positions including MIRU4, MIRU24, MIRU26, MIRU40, VNTR1895 and VNTR11b in 28 strains of different BCG in the vaccine samples were respectively (2×77)+122, (2×54)+393, (5×51)+285, (2×54)+354, (4×57)+281 and (3×69)+67.
Conclusion: BCG strain using in Iran is the very Pasteur 1173p2 and may be used as
اطلاعات موجودي :
فصلنامه با شماره پیاپی 59 سال 1392
كلمات كليدي :
#تست#آزمون###امتحان