شناسايي مولكولي تيپ‌هاي كلي سين در سويه‌هاي اشريشياكلي در شهرستان ياسوج

Molecular Identification of the colicin types in Escherichia coli in the Yasuj city

چكيده زمينه و هدف: كلي‌سين‌ها گروهي از باكتريوسين‌ها هستند كه به وسيله سويه هاي اشريشياكلي توليد مي‌‌شوند و باعث مهار رشد ساير سويه‌هاي بيماري‌زاي اشريشياكلي مي‌شوند. امروزه كاربرد سويه‌هاي كلي سينوژنيك به عنوان ميكروارگانيسم‌هاي پروبيوتيك و جايگزيني آنها به جاي تركيبات آنتي‌بيوتيكي مورد توجه قرار گرفته است. هدف اين مطالعه شناسايي تيپ‌هاي مختلف كلي سين در سويه‌هاي اشريشياكلي كامنسال بود. روش بررسي: اين مطالعه توصيفي ـ تحليلي، مقطعي بر روي 120 نمونه مدفوعي اشريشياكلي كامنسال كه به صورت تصادفي از كودكان مراجعه كننده به مراكز درماني در شهرستان ياسوج جدا شد، انجام گرفت. در ابتدا با استفاده از تست‌هاي بيوشيميايي باكتري اشريشياكلي تاييد شد. سپس با استفاده از 9 جفت پرايمر اختصاصي وجود ژن‌هاي كلي‌سين مورد ارزيابي قرار گرفت. داده‌ها با آزمون آماري مجذور كاي تجزيه و تحليل شدند. يافته‌ها: از 120 نمونه اشريشياكلي كامنسال در 85 مورد (8/70 درصد) ژن كلي‌سين شناسايي شد، به طوري كه 11/34 درصد از نمونه‌ها داراي يك ژن، 89/45 درصد دو نوع و 20 درصد، داراي بيش از دو نوع ژن كلي‌سين بودند. يك سويه با شش نوع كلي‌سين در بين نمونه‌ها مشاهده شد. بيشترين و كمترين فراواني به ترتيب مربوط به ژن‌هاي IaIb و A.N.S4 بودند. نتيجه‌گيري: سويه‌هايي با بيش از يك ژن كلي‌سين فراواني بالايي را نشان دادند. اين سويه‌ها داراي يك مزيت انتخابي براي مهار سويه‌هاي حساس مي‌‌باشند، بنابراين حضور كلي سين در دستگاه گوارش، يك فاكتور مهم براي مهار ساير سويه‌هاي اشريشياكلي پاتوژن مي‌‌باشد.

Abstract Background & aim: colicins are a group of bacteriocins produce by Escherichia coli and act against pathogenic bacteria Escherichia coli. Today, the use of colicinogenic strains as probiotic microorganisms and replace them instead of the combination of antibiotics are taken into consideration. Therefore, this study was conducted to identify the different types of colicins in commensal Escherichia coli. Methods: This research was a descriptive - analytic study was performed on 120 stool samples that randomly was isolated from the commensal Escherichia coli in children referred to health centers in the Yasuj city. Firstly, E. coli isolates were determined by common biochemical tests. Then colicin gene existence was analyzed using specific primers 9. Data were analyzed by chi-square test. Results: Of the 120 commensal E. coli in 85 cases (71%) colicin gene has been identified, so that 34/11% of samples containing a gene, 45/89% contain two genes and 20% of the samples had more than two genes. A strain was observed with six different colicin. The highest and lowest frequencies were related to colicin-coding genes IaIb and ANS4. Conclusion: the strains with more than one colicin gene showed a high frequency. These strains have a selective advantage for inhibition sensitive strains. The presence of colicin in the gastrointestinal tract, an important factor is to inhibit other pathogenic Escherichia coli. Keywords: Escherichia coli, Colicin, PCR