بررسي تنوع ژنتيكي در برخي از توده هاي بابونه (Matricaria inodora L.) با استفاده از صفات مورفولوژيك و نشانگرهاي مولكولي RAPD

Study of genetic diversity in several scentless chamomile landraces (Matricaria inodora L.) based on morphological traits and RAPD molecular markers

بابونه به دليل كاربردهاي متعدد در صنايع دارويي و بهداشتي، يكي از مهمترين گياهان دارويي در تجارت جهاني محسوب مي شود. به‌منظور ارزيابي تنوع ژنتيكي توده هاي بومي بابونه براساس نشانگرهاي مورفولوژيكي و مولكولي، 17 توده بومي بابونه متعلق به گونه Matricaria inodora L. كه از نقاط مختلف كشور جمع آوري شده بود در قالب طرح آگمنت كشت و صفات مختلف مورفولوژيكي مورد بررسي قرار گرفت. چهل و چهار آغازگر تصادفي با توالي هاي 10، 15 و 18 جفت نوكليوتيدي مورد استفاده قرار گرفت كه 29 آغازگر براساس كيفيت و اعتبار نتايج بدست آمده از آزمايشات، انتخاب شدند. براي تعيين تشابه بين توده هاي بومي از ضريب تشابه جاكارد استفاده شد و گروه بندي توده ها به روش UPGMA انجام شد. در بين صفات مورد مطالعه، عملكرد گل در بوته، تعداد گل در بوته و وزن هزار دانه بيشترين ضريب تغييرات و روز تا پايان گل دهي و روز تا شروع گل دهي كمترين ضريب تغييرات را نشان دادند. دامنه ضريب تشابه ژنتيكي بين توده هاي بومي بين 72/0-20/0 بود و ميانگين ضريب تشابه ژنتيكي 39/0 برآورد گرديد. تجزيه خوشه اي براساس نشانگرهاي مورفولوژيكي و مولكولي، توده هاي بومي مورد مطالعه را به پنج گروه تقسيم نمود ولي توده هاي بومي داخل گروه ها با يكديگر متفاوت بودند. نتايج تجزيه خوشه اي نشان داد كه تنوع ژنتيكي توده‌هاي جمع آوري شده از توزيع جغرافيايي توده ها تبعيت نمي‌كند.

Chamomile is one of the most important medicinal plants in commerce that has many applications in drug and sanitary industries. In order to evaluate the genetic diversity of different scentless chamomile landraces (Matricaria inodora L.) based on morphological traits and molecular markers, 17 landraces were collected from different areas of Iran. In order to evaluate the morphological traits, the landraces were planted in an augmented design in Fozveh station of Agriculture Research Center of Isfahan. Forty-four arbitrary 10, 15 and 18-mer primers were used for PCR amplification of total genomic DNA. Twenty nine primers were selected based on the quality and reliability of their amplification. Genetic similarity between the genotypes was estimated using Jaccardʹs similarity coefficient and UPGMA method of cluster analysis was conducted on the collected data. Results showed that yield of flower per plant, number of flower per plant, and 1000 grain weight had maximum variance coefficient. Days to end of flowering and Days to flowering had minimum variance coefficient. Genetic similarity coefficient was estimated in a range of 0.20–0.72, with a mean of 0.39. According to the cluster analysis on both morphological and molecular markers, the studied landraces were classified into 5 clusters, but intra-groups landraces were different. Results of cluster analysis showed that genetic diversity was not coordinated to the geographical distribution.