هاپلوگروپ هاي ژنوم ميتوكندري در يك جمعيت از قوم كرد ايراني: ابزاري در تشخيص افراد مجهول الهويه

Mitochondrial Haplogroups of Iranian Kurdish Population: An Efficient Instrument in Diagnosis of Unrecognized Bodies

مقدمه: بررسي ناحيه كنترل متشكل از نواحي HV1، HV2 و SNPهاي موجود در ناحيه رمزشونده ژنوم ميتوكندري در افتراق جمعيت‏ها، اقوام و افراد كاربرد دارد. سرعت ايجاد تنوع نوكليوتيدي ناحيه كنترل ده برابر سريعتر از DNA كروموزومي مي‏باشد و وراثت مادري دارد. از اين ويژگي در انسان‏شناسي، بررسي‏هاي جنايي و قضايي مثلاً شناسايي افراد مجهول‏الهويه استفاده مي شود. هدف از اين تحقيق شناسايي هاپلوگروپ‏هاي اقوام ايراني مي‏باشد. در اين مقاله هاپلوگروپ‏هاي گروهي از جمعيت كرد گزارش مي‏شود. مواد و روش‏ها: در اين مطالعه هاپلوتيپ هاي نواحي فوق و SNPهاي 7028 و 12308 منطقه رمزشونده ژنوم ميتوكندري، 87 نفر از قوم كرد بررسي شد. 2 ميلي‏ليتر خون محيطي از افراد غيرخويشاوند در لوله‏هاي EDTAدار تهيه و ضمن تخليص DNA ژنوميك، نواحي HV1 و HV2 تكثير و تعيين توالي گرديد. توالي‏ها توسط برنامه ClustalX با توالي مرجع كمبريج مقايسه گرديد، پلي مورفيسم‏ها مشخص و از طريق درخت فيلوژنتيك، هاپلوگروپ‏ها تعيين و فراواني آن‏ها مشخص گرديد. براي اطمينان از تعيين هاپلوگروپ‏هاي H و U از روش RFLP استفاده شد. يافته‏ها: در 87 الگوي ميتوكندري حاضر، 262 نوكليوتيد جهش يافته در HV1 ديده شد. هاپلوگروپ‏هاي H, U, K, J, T, L3A مشخص گرديد. هاپلوگروپ‏هاي J و H داراي بالاترين فراواني و هاپلوگروپ‏هاي U و L3a در رتبه بعدي قرار مي‏گيرند. نتيجه‏گيري: در قوم كرد هاپلوگروپ‏هاي اوراسياي غربي غالب است، اگرچه هاپلوگروپ آفريقايي نيز در اين جمعيت ديده شد.

Background: Analysis of the nucleotide composition of the mitochondrial control regions HV1 , HV2 and the SNPs in the coding region are routinely and widely used in differentiation of populations, ethnic groups and individuals. The speed of the nucleotide variation in the sequence of the mitochondrial control regions are at least ten times more than the nuclear genome and uniparental (maternal) inheritance. These characteristics are utilized in anthropology, criminal and judicial investigations such as identifying unrecognized corpse and human remains. The present report is the result of haplogrouping of a Kurdish population, inhabitants of Kermanshah and its suburbs, as part of a broader research to identify the haplogroups of Iranians. Materials and Methods: DNA was extracted from 2 ml whole blood from 87 individuals of Kurdish origin living in Kermanshah and its suburbs. The mitochondrial HV1 and HV2 control regions were sequenced following PCR amplification. The sequence data were compared with Cambridge Reference Sequence, and by using ClustalX program haplogrouping was achieved. For differentiating between H and U haplogroups, the status of two coding SNPs of 7028 and 12308 were also determined by PCR-RFLP. Results: In 87 studied mitochondrial DNA samples 262 nucleotide variants were identified in HV1 region alone. The identified haplogroups were as follows according to their frequency preponderance: J,H,U,L3a and T. Conclusion: In this Kurdish population Eurasian haplogroups were predominant, although African haplogroup was present at a lower frequency.