بيوانفورماتيك و پايگاه‌هاي اطلاعاتي ژنوم غلات (مطالعه موردي برنج)

Bioinformatics and cereal genome databases: A case study in rice

پيشرفت فناوري هاي نوين و سرعت تحقيقات علم ژنتيك منجر به توليد حجم بالاي اطلاعات ژنتيكي در زمينه‌هاي مختلف نظير توالي نوكليوتيد‌ها و اسيد‌هاي‌آمينه، عملكرد ژن‌ها و پروتيين‌ها، جهش‌يافته‌ها و فنوتيپ‌هاي آن‌ها، نشانگرها و استفاده از آن‌ها و موضوعات مرتبط شده است. علاوه بر حجم زياد اطلاعات ژنتيكي، اين اطلاعات پيچيده و داراي تفاوت‌هاي ظريف در روش‌هاي آزمايشي هستند كه مي‌توانند در كيفيت و تفسير اطلاعات تاثير بگذارند. به اين ترتيب، توصيف و طبقه‌بندي اطلاعات مرتبط با ژن ها و اطلاعات فنوتيپي آن ها به طريقي كه امكان مقايسه سريع و آسان آن‌ها فراهم باشد، اهميت بسياري دارد. استفاده از پايگاه‌هاي اطلاعات ژنتيكي مي‌تواند در تكميل و به روز شدن تحقيقات و آگاهي محققين از آخرين يافته‌هاي علمي كمك بسياري نمايد. استفاده از پايگاه‌هاي اطلاعات ژنتيكي در برنامه هاي اصلاحي غلات در سال‌هاي اخير، امري متداول و اجتناب ناپذير بوده است. در اين مطالعه، ضمن بررسي پايگاه‌هاي اطلاعاتي ژنوم برنج، يكي از كاربردي‌ترين پايگاه‌هاي اطلاعاتي غلات معرفي مي شود.

Advances of technology and the speed of genetic researches have enhanced genetic data in different fields like nucleotides and amino acids sequences, genes and proteins functions, mutants and their phenotypes, markers and etc. In addition to its volume, genetic information is complex and has subtle differences in the experimental manners which can influence on the quality and interpretation of the data. Thus it is crucial to describe and categorize the data related to genes and its phenotype information in the way that rapid and easy comparison of them be available. The use of genetic databases can help researchers to complete and update their researches and it awards them of the latest acquisitions of the science. Application of genetic databases in research for cereal is prevalent in recent years. This article will review databases which offer comprehensive information of rice genome and then one of the most usage cereal databases will be introduced.