شناسايي و تنوع ژنتيكي جدايه هايPseudomonas syringae pv. syringae عامل شانكر باكتريايي درختان ميوه هسته دار در چند استان شمالي و مركزي ايران

Identification and genetic diversity of Pseudomonas syringae pv. syringae strains causing bacterial canker in stone fruits in several northern and central provinces of Iran

بيماري شانكر باكتريايي هسته داران با عامل (Pss) Pseudomonas syringae pv. syringae يكي از بيماري‌هاي شايع درختان ميوه هسته دار در استان هاي شمالي و مركزي ايران مي باشد. به منظور شناسايي جدايه‌هاي عامل بيماري، طي سال هاي 1390-1389، 105 جدايه به‌‌دست آمده از باغ‌هاي درختان ميوه هسته دار واقع در مناطق مختلف استان هاي اردبيل، آذربايجان ‌شرقي، گيلان، مازندران، خراسان ‌رضوي، تهران و قزوين از نظر فنوتيپي، بيماري زايي و الكتروفورز پروتيين هاي سلولي و وجود ژن سرينگومايسين (syrB) مورد بررسي قرار گرفتند. جدايه ها از نظر ويژگي هاي فنوتيپي و الگوي پروتيين هاي سلولي اختلاف هاي جزيي نشان دادند. همه جدايه ها روي هلو داراي قدرت بيماري زايي بالايي بودند و از اين نظر مشابه به نظر رسيدند. همه جدايه‌ها به همراه جدايه ي استاندارد، قطعه 752 جفت بازي با آغازگر syrB را تكثير كـردند. تنوع ژنتيـكي بين جدايه ها با دو روش BOX-PCR و IS50-PCR بـررسي شـد. آناليز خـوشه‌اي نتايج به‌دست آمده نشان داد كه در BOX-PCR در سطح تشابه 73 درصد، جدايه ها به 9 گروه و با IS50-PCR به 8 گروه و با تركيب همه آغازگرها به 11 گروه تقسيم شدند. بين تنوع ژنتيكي جدايه‌ها و منشا جغرافيايي آن‌ها ارتباط معني‌داري وجود نداشت. نتايج نشانگر وجود تنوع ژنتيكي بالا درون جدايه هاي مختلف Pss عامل بيماري شانكر باكتريايي درختان ميوه هسته دار بود. در اين بررسي ارتباط مشخصي بين منشا جغرافيايي جدايه ها و گروه هاي به‌دست آمده از بررسي تنوع ژنتيكي آن‌ها مشاهده نشد. واژه‌هاي كليدي: شانكر باكتريايي هسته‌داران، Pseudomonas syringae pv. syringae، تنوع ژنتيكي، BOX-PCR، IS50-PCR

Bacterial canker of stone fruits caused by Pseudomonas syringae pv. syringae (Pss) is widespread throughout Ardebil and Azarbaijane sharghi provinces. In this research samples were collected from various areas in Ardebil, Eastern Azarbaijane, Guilan, Mazandaran, Khorasane Razavi, Tehran and Qazvin provinces during 2010-2011. A total of 105 bacterial isolates were compared based on their phenotypic (physiological & biochemical) characteristics, pathogenicity and total cellular protein profiles (SDS-PAGE). Pss strains showed slight differences in phenotypic characteristics and protein profiles. All 105 strains of Pss tested were highly pathogenic on peach seedlings. All strains appeared to be similar in pathogenicity. All Pss isolates and Pss141 amplified a 752-bp fragment with the syrB primers. Genetic diversity among the strains was assessed by BOX- and IS50-PCR. Strains formed 9 and 8 clusters in the BOX-PCR and IS50-PCR, at 73% similarity level, respectively and by the combination data set of both BOX and IS50-PCR, strains formed 11 clusters. There was no significant correlation between genetic diversity and geographical origin of the isolates. The results demonstrated the existence of a considerable genetic diversity among Pss strains causing canker of stone fruit trees in various provinces of Iran. In this study, no correlation was observed between the Pss strains origin and their clusters. Keywords: Bacterial canker, Pseudomonas syringae pv. syringae, Genetic diversity, BOX-PCR, IS50-PCR.