مطالعه تنوع ژنتيكي گوسفند كردي شيروان با استفاده از نشانگرهاي ريزماهواره و مقايسه ضريب همخوني بدست آمده با استفاده از اطلاعات شجره اي

Genetic diversity inShirvan Kordi sheepusing microsatellite markers and compared toestimation of inbreeding coefficient using pedigree

هدف از اينتحقيق برآورد ضريب همخوني گوسفند كردي شيروان براساس اطلاعات شجره اي و مولكولي بود. در اين پژوهش، ميزان همخوني 7170 راس بره حاصل از 177 قوچ و 2182 ميش كه طي سال‌هاي 1388- 1368 از گله گوسفند كردي ايستگاه پرورش و اصلاح نژاد شيروان جمع‌آوري شده بود، مورد بررسي قرار گرفت. ميانگين ضريب همخوني بر اساس سال پايه 1368، 668/0 درصد برآورد شد. همچنين ضريب همخوني 100 راس حيوان در جمعيت گوسفند كردي با استفاده از 6 جايگاه ريزماهواره‌اي (BM8125، BMS2361، BM6526، BM6438، BMS1004 و BM6444)برآورد شد. در مجموع 34 آلل با ميانگين 67/5 به ازاي هر جايگاه مشاهده شد. ضريب همخوني بر اساس شاخص رايت (FIS) در جمعيت مورد مطالعه، از 1859/0- براي جايگاهBM6526تا 3329/0 در جايگاه BM6438متغير بود. در جايگاه‌هايBM6438وBM6444مقدار شاخصFIS، مثبت بود و به ترتيب 3329/0 و 2287/0 برآورد شد ولي براي ساير جايگاه ها منفي بود. ميانگين ضريب همخوني بر اساس داده‌هاي مولكولي، 2617/0 درصد بدست آمد. بابهره گيرياز تعداد بيشترنشانگر هايژنتيكيباپوششگستردهدرژنومو افزايش تعداد نمونه ممكناستاينبرآورد-هابهمقاديرواقعينزديكترباشند. همچنين نتايجاينتحقيقنشانمي دهدكهبرآوردهايسادهتشابهژنتيكيافرادكهتنهابراساسشراكتآلليبرمبنايتعدادمحدوديجايگاهبدستآمدهاست،نمي تواندمبنايدقيقيبرايبيانروابطومبنايتصيميمگيري هاياصلاحيدرگلهقرارگيرد. ايننتيجهادامهاستفادهازداده هايشجره ايرابه عنوانمبناياصليبرآوردهاپيشنهادمي نمايد. واژه هاي كليدي:گوسفند كردي شيروان، نشانگرهاي ريزماهواره، همخوني

This study was conducted to estimate coefficient of inbreeding of Shirvan Kordi sheep based on molecular and pedigree information. Pedigree of 7170 lambs produced from 177 rams and 2182 ewes collected during 1989 to 2009 in Shirvan Kordi sheep breeding flock were used for calculating inbreeding coefficient. Average inbreeding coefficient of the flock on base year 1989 was estimated as 0.668%. Coefficient of inbreeding was also estimated in this population using 6 microsatellite markers (BM8125, BMS2361, BM6526, BM6438, BMS1004 and BM6444) and 100 blood samples.A total of 34 alleles with an average of 5.67 was observed for each locus. Within population inbreeding (FIS) in Shirvan Kordi sheep breeding flock ranged from -0.1859 for BM6526 to 0.3329 for BM6438. The FIS estimates were positive for BM6438 and BM6444 loci (0.3329 and 0.2287, respectively) and for the other loci were negative. Average inbreeding coefficient based on marker data was estimated as 0.2617%. Microsatellile loci used in this population showed a high polymorphism and can be used for future genetic studies in this population.These estimates may be closer to the true values using more number of genetic markers across the whole genome and higher sample size. Moreover, the results indicated that the estimates of genetic resemblance between individuals based on allelic contribution of a limited number of loci may not be very accurate for measuring the relationships and making breeding decisions in the flocks. Therefore, estimation of inbreeding coefficients using pedigree is suggested.