بررسي فراواني زيرگونه هاي پيلي نوع چهار سودوموناس آيروژينوزا بدست آمده از منابع محيطي، بيماران فيبروزيس سيستيك و سوختگي

Evaluation of Type IV Pilin Sub Groups in Pseudomonas aeruginosa Isolated from Environmental Samples, Cystic Fibrosis and Burn Patients

زمينه و اهداف: پيلي نوع چهار سودوموناس آيروژينوزا با عملكرد هاي گوناگون، واسطه اي مهم در به وجود آمدن تنوع در ساختار ژنومي باكتري محسوب مي شود. بر اساس طبقه بندي رايج، دو زير گونهIVa ، IVb پيلي نوع چهار توسط ژن هايpilA و pilS2 كه كد كننده زير واحد هاي اصلي دو زير گونه پيلي مي باشند سنتز مي شوند. هدف اين مطالعه بررسي ميزان فراواني ژن هاي pilA و pilS2 به عنوان شاخص زير گونهIVa ، IVb از پيلي نوع چهار سودوموناس آيروژينوزا در بين سويه هاي فيبروزيس سيستيك ، سوختگي و ايزوله هاي محيطي مي باشد. مواد و روش كار: تعداد 100 ايزوله سودوموناس آيروژينوزا در طي فروردين 1392 تا آذر1392 جمع آوري گرديد. ايزوله ها از بيماران فيبروزيس سيستيك ، سوختگي و محيطي كه از شبكه فاضلاب مركز مراقبت هاي سوختگي ايزوله شد، بدست آمد. فرايند PCR با استفاده از پرايمرهاي اختصاصي انجام گرفت. تجزيه و تحليل آماري با استفاده از نرم افزار 17 SPSSانجام گرفت. يافته‌ها: ميزان فراواني ژن pilA سودوموناس آيروژينوزا به تفكيك ايزوله ها ،3/63% در سويه هاي فيبروزيس سيستيك، 7/56% در سويه هاي سوختگي و 5/42% در سويه هاي محيطي بود. فراواني ژن pilS2 به تفكيك، 5/57% در ايزوله هاي محيطي،5/67% در سويه هاي فيبروزيس سيستيك و3/73% در ايزوله هاي سوختگي مشاهده شد. نتيجه‌گيري: مطالعه ما نشان داد كه فراواني پيلي نوع چهار در بين سويه هاي سودوموناس آيروژينوزا بدست آمده از منابع مختلف بالا است و زيرگونه IVbاز پيلي نوع چهار در مقايسه با زيرگونه Iva در بين منابع مورد مطالعه از فراواني بالاتري برخوردار مي باشد.

Background and Aim: Type IV pilin molecule in Pseudomonas aeruginosa with wide functions, has important role in the diversity of the bacterial genome. According to the latest classification, Type IV pilin is divided to two main subtypes; IVa, IVb. The major subunit encoding Type IV pilin subtypes; IVa, IVb is pilA and pilS2 genes respectively which serve as a marker for the detection of the Type IV pilin subtypes. The purpose of the current study was to evaluate the frequency of pilA and pilS2 gene in cystic fibrosis, burns, and environmental isolates. Materials and Methods: The samples for P.aeruginosa were collected from cystic fibrosis, burns, and environment wastewater during the April 2013 to December 2013. Samples were cultured and identified using microbial and biochemical methods. DNA of isolates was extracted by commercial kit. PCR was performed using specific primers. Statistical analysis was done using SPSS 17.0 software. Results: A total of 100 P.aeruginosa isolates were collected; 30 cystic fibrosis, 30 burn, 40 environmental. The prevalence of the pilA gene were 63.3% , 56.7% and 45/2% for cystic fibrosis, for burns and environmental strains . The PilS2 gene frequency was 57.5% of the environmental isolates, 67.5% of cystic fibrosis strains and 73.3 % of the isolates were burned. Conclusions: Our study showed that the frequency of P.aeruginosa T4P major pilin subunits in our P. aeruginosa population was high. The incidence of pilS2 gene was greater than pilA and was more frequent in Pseudomonas aeruginosa isolated from hospitalized burn patients.