بررسي چند شكلي ژن STAT5b و ارتباط آن باصفات توليد شير در گاوهاي هلشتاين استان خراسان رضوي

Study of Polymorphism in STAT5b Gene and Its Association with Milk Production Traits in Holstein Cows of Khorasan Razavi Province

به منظور بررسي ارتباط بين چند شكلي در ژن STAT5b با برخي صفات توليدي شير در گاوهاي هلشتاين از تعداد 150 راس گاو نژاد هلشتاين از 6 گله در استان خراسان رضوي خون گيري انجام شد. استخراج DNA به روش نمكي بهينه يافته -كلروفورم و تكثير يك قطعه 337 جفت بازي از اين ژن كه شامل بخشي از اگزون 16 بود، توسط واكنش زنجيره اي پليمراز (PCR) با استفاده از يك جفت آغازگر اختصاصي صورت گرفت. ژنوتيپ هرحيوان با استفاده از روش تفاوت فرم فضايي رشته هاي منفرد (SSCP) بوسيله ژل پلي اكريل آميد و رنگ آميزي نيترات نقره تعيين شد. براي اين ژن در ناحيه مورد مطالعه 5 الگوي باندي AD, AB, CC, BB, AA به ترتيب با فراواني 0667/0 , 1933/0 , 2067/0 , 4467/0و 0867/0 مشاهده گرديد. درصد فراواني آللي براي آلل ها ي D, C, B, A به ترتيب 33/33 , 67/41, 67/20و 33/4 بود. داده هاي آماري با استفاده از نرم افزار POPGENE نسخه 31/1 مورد تجزيه و تحليل قرار گرفت. آزمون كاي مربع (2?) نشان داد كه جمعيت مورد مطالعه در تعادل هاردي واينبرگ قرار نداشت. تعداد آلل موثر و شاخص شانون (I) به ترتيب 0366/3 و 1928/1 بود. ارتباط چند شكلي ها و صفات مورد مطالعه بوسيله رويه ي مختلط نرم افزار SAS نسخه 1/9 ارزيابي شد. نتايج نشان داد كه چند شكلي هاي مشاهده شده در اين ژن بطور معني داري با توليد شير مرتبط بود ( 0004/0 > p ) ... چند شكلي در ژن مذكور با درصد چربي شير و درصد پروتيين شير فاقد ارتباط معني دار آماري بود. با توجه به برتري ژنوتيپ هاي CC براي صفت توليد شير مي توان انتظار داشت با انتخاب دام هاي حامل آلل هاي Aو C، روند بهبود ژنتيكي براي توليد شير بيشتر را تسريع بخشيد.

In order to study STAT5b gene polymorphisms and its association with milk production traits in Holstein dairy cows in Khorasan Razavi Province, blood samples were collected from 150 Holstein cows from six herds in Khorasan Razavi Province. DNA was extracted using modified the salting out-Chloroform method and polymerase chain reactions (PCR) were carried out by specific primer pairs for amplification of a fragment of 337 bp from part of exon 16 of STAT5b gene. All animals were genotyped by single stranded conformation polymorphism (SSCP) analyses by Acrylamide gel and using silver staining. Five SSCP patterns (genotypes) of AA, BB, CC, AB, and AD were identified with the frequencies of 0.0667, 0.1933, 0.2067, 0.4466, and 0. 867, respectively. Statistical data was analyzed using the POPGENE software. Chi-square test (?2) showed that this population was not in the Hardy-Weinberg equilibrium. Effective allele numbers (Ne) and Shannon’s information index (I) were 3.0366 and 1.1928, respectively. Results showed that SNPs were significantly associated with milk yield in Khorasan Razavi Holstein cows (P < 0•0004). The cows with combination genotype CC had the highest milk yield. These results suggested that the STAT5b may be a potential genetic marker for milk production selecting. The association between polymorphism in this gene with milk fat and milk protein percentage was not significant