ارزيابي بيان RNA غير كد كننده بلند PSORS1C3 قرار گرفته در ناحيه بالا دست ژن Oct4 در سلول‏هاي بنيادي و سرطاني

A Long Non-coding RNA, PSORS1C3, Located Upstream of the Human Oct4 Gene is Expressed in Pluripotent and Tumor Cell Lines

هدف: گروه جديدي از ژن‏هاي شناخته شده در ژنوم انسان RNAهاي غيركدكننده بلند (lncRNA) است كه از بخش وسيعي از ژنوم يوكاريوت‏ها رونويسي شده و در تنظيم فرآيند‏هاي متنوع زيستي از جمله پرتواني سلول‏هاي بنيادي و نورون‏زايي دخالت دارد. بررسي‏هاي جديد نشان دهنده نقش تشديد كنندگي lncRNA ها بر بيان ژن‏هاي مجاورشان است. Oct-4 يك عامل كليدي در خودبازسازي و حفظ حالت پرتواني در سلول‏هاي بنيادي جنيني و سلول‏هاي كارسينوماي جنيني است. اين عامل نقش مهمي در حفظ حالت تمايز نيافته سلول‏هاي بنيادي ايفا مي‏كند و بيان آن بايد به دقت در اين سلول‏ها تنظيم شود، چرا كه بيان خيلي بالا و خيلي پايين آن باعث تمايز سلول‏ها مي شود. مواد و روش‏ها: RNA غير كدكننده بلند PSORS1C3 دقيقاً در بالادست Oct4 قرار گرفته است و احتمالاً نقش تنظيمي روي آن دارد. اما تاكنون الگوي بياني اين lncRNA در سلول‏هاي بنيادي و سرطاني بررسي نشده است، در اين پژوهش بيان PSORS1C3 در 23 دودمان سلولي از طريق واكنش RT-PCR بررسي شد. نتايج: يافته‏هاي ما نشانگر بيان متفاوت اين RNA غير كد كننده بلند در سلول‏هاي بنيادي جنيني (NT2) و دودمان‏هاي سلولي سرطاني است. علاوه بر بيان PSORS1C3 در سلول‏هاي پرتوان، بيان اين ژن در تعداد معدودي از رده‏هاي سلولي جدا شده از تومورهاي معده (AGS)، كارسينوماي مثانه (5637)، آدنوكارسينوماي كولوركتال (Ht-29)، كارسينوماي سلول‏هاي هپاتوسيت (HepG2) و آدنوكارسينوماي پروستات (PC3) تاييد شد. نتيجه‏گيري: اين پژوهش توانست براي اولين بار بيان اين lncRNA را در سلول‏هاي سرطاني و سلول‏هاي بنيادي نشان دهد.

Objectives: Long non-coding RNAs (lncRNAs), a vast class of recently discovered non-coding genes in the human genome, have been implicated in the regulation of several biological processes, including the maintenance of stem cell pluripotency and neurogenesis. New evidences have emerged that some long IncRNAs act as enhancers for their neighboring genes. Oct4, also known as POU5F1 and Oct3/4, functions as a master regulator in maintaining the properties of pluripotency and self-renewal of embryonic stem (ES) cells and embryonal carcinoma (EC) cells. Oct-4 expression must be tightly regulated; too much or too little expression can lead to cell differentiation. Methods: PSORS1C3, an IncRNA, is located upstream of the Oct4 gene. This IncRNA could potentially impact the level of Oct4 expression. Here, we have investigated potential expression of PSORS1C3 on 23 different human pluripotent and cancer cell lines by means of RT-PCR. Results: Our results revealed a noticeable expression of PSORS1C3 both in a well-known pluripotent cell line (NTera2/NT2) and five different cancer cell lines (AGS, 5637, Ht-29, HepG2 and PC3). Conclusion: We detected the expression of PSORS1C3 for the first time in both cancer cell lines and stem cells.