تعيين تنوع ژنتيكي و بيماري زايي جدايه‌هاي Fusarium oxysporum از چغندر‌قند در ايران

Pathogenic and genetic variation of Iranian isolates of Fusarium oxysporum from sugar beet in Iran

تنوع ژنتيكي و بيماري زايي 13 جدايه قارچ Fusarium oxysporum كه طي سال‎هاي 1387-1378 از مزارع چغندرقند شش استان كشور ايران جمع‌آوري شده بود، مورد بررسي قرار گرفت. تنوع بيماري زايي آنها با استفاده از روش غوطه‎ورسازي ريشه گياهچه‌هاي چهار‌هفته‌اي در سوسپانسيون اسپور در لوله آزمايش انجام شد. بر اين اساس جدايه‌ها به دو گروه بيماري زاي قوي و ضعيف دسته‌بندي شدند. تنوع ژنتيكي جدايه‎ها با استفاده از ?? آغازگر تصادفي و به روش RAPD ارزيابي شدند. بر اين اساس چند شكلي قابل ملاحظه‎اي بين جدايه‌هاي مورد بررسي مشاهده شد. گروه‎بندي خوشه‌اي جدايه‎ها با استفاده از UPGMA به كمك نرم‌افزار MVSP، جدايه‌ها را به پنج گروه طبقه‎بندي كرد. رابطه مشخصي بين تنوع ژنتيكي بر اساس RAPD-PCR با بيماري زايي جدايه‌ها يافت نشد، اما مجزا شدن برخي از جدايه‎ها از سايرين با مناطق جغرافيايي آنها در ارتباط بود. DNA ژنومي جدايه‌ها با كمك آغازگرهاي ITS1 و ITS4 تكثير شد. محصول تكثير شده از DNA جـدايه‌هاي مختلف ، با آنزيم‌هاي برشگر TaqI ,HaeIII ,EcoRI هضم گرديد. آناليز ITS-RFLP جدايه‎ها الگوي باندي مشابهي را نشان داد.

Pathogenicity and genetic variability of 13 Fusarium oxysporum isolates collected from sugar beet field of six provinces of Iran during 1999- 2008 were evaluated. Pathogenic variability of the isolates was determined using a root-dip assay in spore suspension in test tubes for four- week plants. The isolates were classified into strong and weak pathogenic groups. A total of 15 RAPD primers were used for the isolates genetic diversity evaluation. On this basis, high polymorphism was observed among the isolates. Cluster analysis (UPGMA) of the isolates using the MVSP software package classified them into five groups. There was a relationship between RAPD results and geographical origins of the isolates. However, no relationship was found between RAPD results and pathogenicity. Genomic DNA of isolates was amplified using ITS1 and ITS4 primers. The amplified DNA products of the isolates was digested by three restriction enzymes EcoR1, Taq1 and HaeIII. ITS- RFLP analysis showed similar banding pattern the isolates.