استفاده از مشخصات ظاهري و نشانگر PCR- SCAR به منظور شناسايي نماتد ريشه گرهي (Meloidogyne spp.) شايع در گلخانه‌هاي منطقه سردسيري استان كهگيلويه و بويراحمد

Application of Morphological Characters and PCR- SCAR Markers for Identification of Dominant Species of Root-knot Nematode (Meloidogyne spp.) in Glasshouses of Cold Region of Kohgiluyeh and Boyer-Ahma

نماتدهاي ريشه‌گرهي، جنسMeloidogyne ، از عوامل محدودكننده كشت محصولات صيفي، ازجمله گوجه‌فرنگي و خيار هستند. مبارزه با نماتدهاي ريشه‌گرهي، مستلزم ‌شناسايي دقيق آن‌ها است. به منظور شناسايي گونه شايع نماتد ريشه‌گرهي در ناحيه سردسيري استان كهگيلويه و بويراحمد (شهرستان‌هاي بويراحمد و دنا)، پس از جداسازي و خالص‌سازي نماتد و تكثير آن بر روي رقم حساس گوجه‌فرنگي، براساس صفات ظاهري لارو سن دوم و نقوش انتهاي بدن نماتد ماده بالغ، جدايه‌ها تشخيص داده شدند. به منظور تشخيص مولكولي، با استفاده از كيت، DNA ژنومي از مخلوط كيسه تخم و لارو سن دوم استخراج و با كمك سه جفت آغازگر اختصاصي inc، arو jav انتخاب شده براساس تعيين توالي نواحي به دست آمده از نشانگر RAPD تكثير شدند. در هر 10 جمعيّت مورد بررسي يك قطعه 670 جفت‌ بازي توسط جفت آغازگر javf/javr تكثير گرديد ولي توسط آغازگرهاي inc و ar كه به ترتيب آغازگرهاي اختصاصيM. incognita و M. arenaria مي‌باشند، هيچ قطعه‌اي حاصل نشد. براساس مطالعات مولكولي و مشخصات ظاهري، گونه شايع ناحيه سردسيري استان، M. javanica تعيين گرديد.

Abstract Root-knot nematodes (Meloidogyne spp.) are one of the major limiting factors for the successful production of green-house crops, including tomatoes and cucumber. Accurate identification of nematodes is important in the management program. Identification of the dominant species of root-knot nematode in the cold region of Kohgiluyeh and Boyer-Ahmad province (counties of Boyer-Ahmad and Dena), Iran, was done based on morphology of J2s and females as well as PCR-SCAR. For molecular identification, by using DNA extraction kit, DNA extracted from a mixture of eggs and second stage juveniles. The SCAR primers Fjav/Rjav, Finc/Rinc and Far/Rar were used for producing species specific products of 670bp, 1200bp and 420bp. The Fjav/Rjav primer set, used to detect M. javanica, amplified a 670bp fragment in all of the studied populations. Based on the morphological and molecular studies, the species of the root-knot nematode was identified as M. javanica.