Current status of Cucurbit aphid-borne yellows virus in some greenhouse and open field cucumber in Iran

وضعيت ويروس زردي شته‌زاد كدوييان در برخي گلخانه‌ها و مزارع خيار در ايران

زردي و ضخيم شدن برگ‌ها از شايـع‌ترين نشانه‌هاي آلودگي‌هاي ويروسي در گلخانه‌ها و مـزار‌ع خيـار در ايران مي‌باشند. در سال‌هاي 1391-1389 از مناطق عمده كشت خيار در نه استان كشور، نمـونه‌هاي برگ خيار با نشـانه‌هاي شبيه به آلودگي به ويروس زردي شته زاد كدوييان (Cucurbit aphid-borne yellows virus, CABYV) از گلخانه‌ها و مزارع خيار (به ترتيب 439 و 106 نمونه) جمع‌آوري و آلودگي آنها به ويروس CABYV با آزمون‌هاي سرلوژيكي الايزا (DAS-ELISA) و نسخه برداري وارونه (RT-PCR) بررسي شد. به ترتيب 44 و 43 درصد نمونه‌ها از گلخانه‌ها و مزارع خيـار آلوده به ويـروس CABYV بودند. آلــودگـي هم زمـان 4/9 درصـد از نمـونـه‌هاي آلــوده به CABYV، به ويــروس زردي سبزرد كدوييان (Cucurbit chlorotic yellows virus, CCYV) و ويروس كوتولگي زرد كدوييان (Cucurbit yellow stunting disorder virus, CYSDV) مشاهده شد. ميزان آلودگي هم زمان نمونه‌ها به دو ويروس (CABYV+CCYV) بيش از تركيب دوتايي (CABYV+CYSDV) بود. نمونه‌هاي آلوده به ويروس CABYV در آزمون DAS-ELISA و RT-PCR با دو آغازگر اختصاصي براي دو استرين (C and R) اين ويروس بررسي شد. نتايج حاكي از آلودگي جدايه‌هاي ايراني به استرين (C) و عدم آلودگي آنها به استرين نوتركيب (R) بود. آلودگي نمونه‌هاي مورد بررسي به استرين (C) ويروس زردي شته زاد كدوييان (CABYV) از طريق تعيين توالي قطعه تكثير يافته نه جدايه ايراني تاييد گرديد. بر اساس نتايج حاصل از آناليز تبارزايي جدايه‌هاي ايراني CABYV مورد بررسي در اين تحقيـق در گروه استرين (C) ولي در دو زير گروه مستقل از يكديگر قرار گرفتند كه نشانگر وجود دو منشا آلودگي مستقل از يكديگر به ويروس زردي شته زاد كدوييان در ايران مي‌باشد.

Yellowing and thickening are the most prevalent viral symptoms on cucumber grown in the greenhouses and open fields in Iran. Surveys were conducted from 2010 to 2012 in the major cucumber growing areas in the nine provinces, targeting especially the greenhouse plantations. Cucumber leaf samples showing symptoms like Cucurbit aphid-borne yellows virus (CABYV, genus Polerovirus, family Luteoviridae) infection, were collected from greenhouse (n=439) and open field- grown cucumbers (n=106) and tested for the presence of CABYV by DAS-ELISA and RT-PCR methods. 44% and 43% of collected samples from the greenhouses and open fields were infected to CABYV, respectively. Furthermore, CABYV positive samples were tested for the simultaneous infection of Cucurbit chlorotic yellows virus (CCYV) and Cucurbit yellow stunting disorder virus (CYSDV). Mixed infections with either CCYV or CYSDV were also confirmed in 9.4% of the CABYV-infected samples. The CABYV and CCYV combination was more prevalent than CABYV and CYSDV combination. Strain-specific RT-PCR confirmed the presence of common strain (CABYV-C) in all tested samples. Nine Iranian CABYV isolates were partially sequenced and sequence analysis has confirmed their assignment to the CABYV-C strain. The phylogenetic analysis revealed that although belonging to the CABYV-C, the Iranian cucumber CABYV isolates clustered within this strain in two phylogenetically distinct subgroups which might have an independent origin and/or introduction in Iran. This work provides further information on the natural occurrence of CABYV in Iran, including yet unreported characterization of CABYV-C strain on cucumbers grown in greenhouses and fields.