بررسي تنوع ژنتيكي گياه Ferula assa-foetida L. در جنوب شرق ايران، با استفاده از نشانگر مولكوليRAPD

Genetic diversity of Ferula assa-foetida L. germplasms using RAPD analysis in southeast of Iran

آنغوزه (Ferula assa-foetida L.) گياهي مرتعي متعلق به تيره چتريان (Apiaceae) و بومي نواحي استپي ايران و بخش‌هايي از افغانستان است. در اين تحقيق، تنوع ژنتيكي ژرم پ?سم آنغوزه در جنوب شرق ايران (استان‌هاي كرمان ويزد) بـا اسـتفاده از نـشانگر مولكـولي RAPD مورد ارزيابي قرار گرفت. برگ‌هاي تازه و جوان گياه آنغوزه از 30 رويشگاه مختلف جمع‌آوري گرديد. استخراج DNA به روش CTAB تغيير يافته از برگ انجام شد. از 15 آغازگر تصادفي كه در واكنش PCR استفاده شد، تعداد 10 آغازگر نوارهاي بهتري توليد كردند. از اين تعداد آغازگر، 118 قطعه چندشكل بدست آمد كه براساس حضور يا عدم حضور در نواربندي هر جمعيت امتيازدهي شده و جهت آناليز انتخاب شدند. ماتريس صـفر و يك، توسط نرم‌افزار NTSYS-pc با استفاده از ضريب تشابه دايس به ماتريس فاصـله تبـديل شـد و سـپس بـا اسـتفاده از الگوريتم ميانگين فاصله (UPGMA) دندوگرام مربوطه رسم شد. بر اين اساس 30 جمعيت مـورد بررسـي در5 گـروه جايـابي شدند. ك?ستر حاصله تا اندازه‌اي با تنوع جغرافيايي همخواني داشت. نتايج تجزيه به مؤلفه‌هاي اصـلي بـا نتـايج تجزيه ك?سـتر تقريباً مشابه بود. نتايج حاصل از اين تحقيق نشان داد كه استفاده از تكنيك RAPD براي ارزيابي تنوع ژنتيكي بـين جمعيت‌هاي مختلف جغرافياييمناسـب مي‌باشد.

Ferula assa-foetida L. is on of most important medicinal plant. The genus Ferula belongs to the Apiaceae family grow in Iran and Afghanistan. The objective of this study was to assess the genetic variation in germplasm of Ferula assa-foetida collected from two provinces in southeast of Iran using RAPD marker. The Ferula assa-foetida leave were collected from 30 various regions in Kerman and Yazd provinces. DNA was extracted from leave using modified CTAB method. From the 15 used primers in PCR, 10 primers with better bands were selected for analysis. The127polymorphic bands obtained by these primers were scored. The binary matrix was converted to distance matrix by applying Dice similarity coefficient in NTSYS-pc (Ver 2.02) software. Then, the distance matrix was analyzed using (UPGMA) and the phyllogenic dendrogram was plotted. Based on the results, investigated populations were clustered in5 groups. The obtained clusters based on RAPD markers to some extent matched with the geographical origin of the studied populations of Ferula assa-foetida. Furthermore, the obtained results of principal component analysis method were similar to the results of cluster analysis. The results indicated that RAPD technique is an efficient tool for assessing genetic diversity in these populations.