عنوان مقاله :
مطالعه ساختار ژنتيكي پايكاي افغاني (Ochotona rufescens) با استفاده از توالي ناحيه D-Loop ژنوم ميتوكندريايي در خراسان شمالي
عنوان فرعي :
Genetic structure of Afghan Pika (Ochotona rufescens) populations based on D-loop region of the mitochondrial genome in Northern Khorasan Province
پديد آورندگان :
خليلي‌پور، اولياقلي نويسنده گروه محيط زيست، دانشكده منابع طبيعي، دانشگاه تهران، تهران، ايران Khalilipour, Olyagholi , عليزاده شعباني، افشين نويسنده گروه محيط زيست، دانشكده منابع طبيعي، دانشگاه تهران، تهران، ايران Alizadeh Shabani, Afshin , رضايي، حميدرضا نويسنده گروه محيط زيست، دانشكده منابع طبيعي، دانشگاه علوم كشاورزي و منابع طبيعي گرگان، گرگان، ايران Rezaei, Hamid Reza , كابلي، محمد نويسنده گروه محيط زيست، دانشكده منابع طبيعي، دانشگاه تهران، تهران، ايران Kaboli, Mohammad , اشرفي، سهراب نويسنده دانشگاه تهران ,
اطلاعات موجودي :
فصلنامه سال 1393 شماره 20
كليدواژه :
خراسان شمالي , ساختار ژنتيكي , gene flow , genetic structure , Fst , جريان ژن , Haplotype diversity , Northern Khorasan , پايكاي افغاني (Ochotona rufescens) , Afghan Pika (Ochotona rufescens) , تنوع هاپلوتيپي
چكيده فارسي :
در پژوهش حاضر، با استفاده از ناحيه D-Loop ميتوكندريايی، تنوع ژنتيكی پايكای افغانی (Ochotona rufescens) در بين چهار جمعيت مختلف در استان خراسان شمالی بررسی و تحليل شد. به اين منظور، تعداد 16 فرد (4 فرد از هر جمعيت) از چهار منطقه حفاظت شده (قرخود، گلول-سرانی، سالوك و ساريگل) جمع‌آوری و پژوهش‌های آزمايشگاهی انجام شد. عوامل ژنتيكی بين و درون جمعيت‌های پايكا از قبيل تنوع ژنتيكی و نوكلئوتيدی، تفاوت هاپلوتيپی، ميزان تفاوت ژنتيكی بر اساس آماره F، جريان ژن (Nm) شاخص توزيع شكل گاما، آزمون و جدايی از طريق فاصله جغرافيايی (IBD) محاسبه و مقايسه شد. به‌طور كلی، با بررسی قطعه 483 جفت بازی 25 جايگاه متغير، 457 جايگاه حفاظت‌شده و 10 هاپلوتيپ مختلف شناسايی شد. مقدار پايين (21/0) ولی معنی‌داری (P0.5) و شاخص تاجيما 37/0 (P>0.1) محاسبه گرديد و نشان داد كه جمعيت در گذشته گسترش ناگهانی نداشته است.
چكيده لاتين :
This study was carried out for genetic diversity of Afghan Pika (Ochotona rufescens) among four different populations in Northern Khorasan Province using D-Loop region of mitochondrial gene. The sixteen specimens were trapped from four different sanctuaries (Ghorkhod, Golol-Sarani, Salouk and Sarigol) and transferred to Laboratory. The intra and inter population genetic factors (haplotype and nucleotide diversity, haplotype differentiation among populations, Fst, Nm, gamma distribution parameter, mismatch distribution, TajimaʹD neutrality test and Isolation by distance) were estimated and the results were compared among the populations. Finally, data set with 483 bp was used for each individual. The results showed 25 polymorphic, 457 conserved sites and 10 different haplotypes. The low value of Fst (Fst=0.21, P0.5) and Tajima ʹD test (0.37, P>0.1) showed no population expansion and relatively stable population sizes.
عنوان نشريه :
تاكسونومي و بيوسيستماتيك
عنوان نشريه :
تاكسونومي و بيوسيستماتيك
اطلاعات موجودي :
فصلنامه با شماره پیاپی 20 سال 1393
كلمات كليدي :
#تست#آزمون###امتحان
