جداسازي DNA با استفاده از روش CTAB از گونه شقايق دريايي Anemonia sp.Anem در خليج‌فارس

DNA Isolation Using the CTAB Method from Species of Sea anemone Anemonia sp. PG

شقايق‌هاي دريايي از راسته (Actiniaria) گروهي از آبزيان دريايي هستند كه اكثر گونه‌هاي آن ساكن صخره‌هاي مناطق گرمسيري هستند. اين مطالعه در آبان ماه 1392 انجام شد. هدف از اين مطالعه استخراج DNA جهت انجام مطالعات مولكولي از شقايق دريايي گونه Anemonia sp. PG از خليج‌فارس و بررسي مشكلات ناشي از استخراج DNA در شقايق‌ها بود. در اين تحقيق جداسازي DNA با استفاده از روش CTAB از شقايق دريايي گونه Anemonia sp. PG انجام شد كه با تغييراتي در پروتكل استخراج استاندارد و بهينه كردن آن همراه بوده است و نهايتاً مقادير زيادي از DNA خالص و باكيفيت و عاري از هرگونه آلودگي، مانند پلي ساكاريد (موكوپلي ساكاريد)، كه مي‌تواند در انواع مختلف تجزيه‌وتحليل‌هاي مولكولي مورداستفاده قرار بگيرد، به دست آمد . نتايج حاصل از الكتروفورز ژل آگارز، اسپكتوفتومتر و تعيين توالي بخشي از ژنوم، نشان‌دهنده كيفيت مطلوب DNA استخراجي از شقايق دريايي Anemonia sp. PG بود. مزيت اين روش ساده بودن، ارزان بودن، اجتناب از استخراج ژنوم همزيست شقايق و همچنين حذف آلودگي‌هاي موكوپلي ساكاريدي مي‌باشد كه به علت اين آلودگي‌ها بسياري از روش‌هاي بيو‌شيميايي استاندارد براي جداسازي اسيد نوكلييك در برخي موجودات دريايي مانند اعضاي شاخه مرجانيان موثر نيست.

Sea anemones (order Actiniaria) are groups of marine aquatic that most its species are habitant in tropical reefs. This study was conducted in October 2013. The purpose of this study was extractiing of DNA for to do molecular studies from sea anemone of Anemonia sp. PG specie from Persian Gulf and checking the Problems resulting from the extraction of DND. In this research the isolation of DNA performed using the CTAB method from the sea anemone of specie Anemonia sp. PG that had associated with the changes in the standard extraction protocol and its optimization and finally, large amounts of purified DNA and quality and free from any contamination obtained, such as polysaccharides (Muccopolysaccharides), which can be used for a variety of molecular analysis. The results of agarose gel electrophoresis, spectrophotometer and partial sequencing of the genome was represented the good quality of extracted DNA from the sea anemone Anemonia sp. PG. The advantages of this method are its simplicity, low cost, avoiding the symbiotic genome extraction of anemone and also removal of mucopolysaccharides contaminants that many of standard biochemical methods for the isolation of nucleic acids in some marine organisms, such as members of hydrozoans are not effective due to these contaminations.