تعيين هويت مولكولي و مطالعه شجره شناسي بر اساس ژن ماتريكس (M) ويروس آنفلوانزاي پرندگان (H9N2) در ايران بين سالهاي 1387- 1377

Molecular characterization and phylogenetic study based on matrix gene of avian influenza viruses (H9N2) in Iran during 1998-2008

زمينه مطالعه: در دهه گذشته موارد متعددي از بيماري آنفلوانزاي پرندگان تحت تيپ H9N2 بصورت پانزيوتيك رخ داده و از سال 1377 موارد متعددي از بيماري آنفلوانزاي پرندگان (تحت تيپ H9N2 ) در صنعت طيور ايران گزارش شده است و از آن زمان واكسن كشته H9N2 براي كنترل بيماري در ايران استفاده شد. هدف: هدف از اين مطالعه بررسي تعيين هويت مولكولي و شجره شناسي بر اساس ژن ماتريكس آنفلوانزاي پرندگان تحت تيپ H9N2 جدا شده از گلههاي گوشتي استان تهران از سال1377- 1387 ميباشد. روش كار: در اين مطالعه منطقه كد كننده ژن ماتريكس هشت ويروس آنفلوانزاي پرندگان H9N2 جداسازي شده از گلههاي گوشتي استان تهران ازسال 1998 تا2007 به طور كامل تعيين توالي گرديد. نتايج: تجزيه و تحليل حاصل از بررسي توالي مناطق ژن ماتريكس ومطالعه شجره شناسي ويروسهاي مورد مطالعه بيانگر اين است كه توالي ژني اين منطقه از ويروسهاي جداسازي شده در مقايسه با توالي سويه استاندارد كه در بانك ژن وجود دارد، تفاوتيهايي را در سطوح مختلف نشان ميدهد. تجزيه و تحليل سكانس ژن ماتريكس نشان از جهشهايي در اين ژن ميباشد. مطالعه شجره شناسي نشان ميدهد كه اين ويروسهاي جداسازي شده مربوط به تحت دودمان G1 ميباشند. دراين مطالعه نشان داده شده است كه سويههاي ايران بر اساس اين ژن به دو گروه تقسيم گرديده اند. همچنين در اين مطالعه نشان داده شده است ژن ماتريكس ويروسهاي H9N2 سويههاي ايران در بين سالهاي مورد مطالعه بيشترين شباهت را به سويههاي پاكستان، فلسطين اشغالي و امارت متحده عربي دارد. نتيجهگيرينهايي: اين مطالعه نشان ميدهد كه ژن ماتريكس سويههاي در حال گردش در ايران دچار تغيير شده وحفاظت در مورد اين ژن رخ نداده است. نتايج اين مطالعه بر پايش دقيق و ادامه دار در زمينه بيماري آنفلوانزاي پرندگان در كشور را تاكيد ميكند.

BACKGROUND: H9N2 avian influenza viruses (AIV) A have become panzootic in Eurasia over the last decade and have caused several human infections in Iran since 1998 and inactivated vaccine has been used in chickens to control the disease. OBJECTIVES: The purpose of this study was to analyze H9N2 viruses that have infected broiler in Tehran Province, Iran between 1998 and 2008 based on Matrix gene. METHODS: The complete coding region of Matrix (M) gene from 8 of H9N2 subtype isolated from chicken flocks in Tehran Province during 1998-2007 was amplified and sequenced. RESULTS: Sequence analysis and phylogenetic studies of H9N2 viruses on the basis of data of viruses in this study and other selected strains available in the GenBank were conducted and determined variations among these sequences at different levels. Sequence analysis revealed a large number of similar substitution mutations and close evolutionary relation among sequences of M gene. Phylogenetic analysis showed that all our isolates belonged to the G1-like sublineage. In this study, it was determined that Iran’s isolates have been in two separate branches and have the most similarity with Pakistan, United Arab Emirate and occupied Palestine’s isolates. CONCLUSIONS: The available evidence indicates that M genes of H9N2 circulating in Iran during the past years were not well conserved. Our finding emphasizes the importance of reinforcing AIV surveillance.