شناسايي و بررسي تنوع ژنتيكي جدايه‌هاي Botrytis cinerea عامل كپك خاكستري توت‌فرنگي در استان كردستان

Identification and Study of Genetic Diversity of Botrytis cinerea Isolates Caused Strawberry Grey Mold in Kurdistan Province

تعداد 19 جدايه‌بوتريتيس از توت‌فرنگي­‌هاي داراي علايم بيماري كپك خاكستري از مزارع و گلخانه‌ كشت هيدروپونيك توت‌فرنگي از استان كردستان جمع­آوري شدند. جدايه­ها براساس خصوصيات مورفولوژيكي به‌عنوان گونه Botrytis cinerea Pers.: Fr., تشخيص داده شدند. به‌منظور تاييد و شناسايي بيشتر گونه موردنظر به روش مولكولي از آغازگرهاي اختصاصي C729 استفاده شد. جدايه­هاي مورد بررسي با انجام PCR با آغازگر اختصاصي و تكرار آزمايش باند 700 جفت‌بازي مختص گونه را تكثير كردند. تنوع ژنتيكي جدايه‌هاي موجود با استفاده از نشانگرهاي مولكولي RAPD مورد بررسي قرار گرفت. براساس نتايج به‌دست آمده از مطالعه تنوع ژنتيكي، جدايه‌ها در چهار گروه اصلي قرار گرفتند. با توجه به نحوه‌ي گروه­بندي جدايه­ها، در نگاه اول مشاهده شد كه گروه جدايه­هاي گلخانه از گروه جدايه­هاي مزارع مختلف تفكيك شدند اما برخي جدايه­ها از اين الگو پيروي نكرده و متفاوت بودند. همچنين در بررسي جدايه­هاي مزارع حومه استان و ارتباط آنها با يكديگر، ارتباط مشخصي بين نزديكي جدايه­ها از لحاظ جغرافيايي و خصوصيات ژنتيكي و الگوي RAPD آنها با هم وجود نداشت بلكه بعضاً مشاهده شد كه برخي جدايه­هاي دور از هم از لحاظ جغرافيايي شباهت بيشتري به همديگر، نسبت به جدايه­هاي جمع‌آوري شده از مزارع نزديك به هم داشتند.

Total of nineteen isolates of Botrytis sp. were collected from infected strawberry plants of hydroponic cultivated greenhouse and fields surround kurdistan province. According to the morphological characteristics, isolates were identified as Botryits cinerea species. For confirming the species identification by molecular method specific primers C729 were used and PCR test repeated twice. The results showed that these isolates amplified the 700 bp band which is specific for this species. Genetic diversity of existing isolates was investigated by RAPD analysis. According to the results obtained, isolates were clustered into four groups. Considering this clustering mode, in first glance, most of the greenhouse isolates were grouped together and separated from the group of field isolates, but some of them didn’t follow the pattern and were divided differently. Likewise, study among field isolates collected surround the province and their relationships, showed that there is no correlation between molecular clustering and geographical origin of these isolatesو but also it was clear that some of the geographically further isolates were more similar to each other rather than isolates from closer geographical regions.