بررسي تغييرات ژنتيكي پورين پروتيين OprD در جدايه هاي باليني پسودوموناس آيروژينوزا مقاوم به ايمي پنم در بيماران سوختگي

Genetic variations of OprD porin protein in imipenem resistant clinical isolates of Pseudomonas aeruginosa in burn patients

زمينه: مقاومت در باكتري پسودوموناس‌آيروژينوزا يكي از مهم‌ترين تهديدها در بروز عفونت غيرقابل كنترل توسط اين عامل فرصت طلب بيمارستاني در بيماران سوختگي است. يكي از مكانيسم‌هاي مقاومت اين باكتري نسبت به داروهاي هيدروفيل، وجود پورين پروتيين OprD در ديواره آن است. هدف: اين مطالعه به منظور ارزيابي تغييرات توالي ژنتيكي ژن OprDدر جدايه هاي پسودوموناس آيروژينوزا مقاوم به ايمي پنم در بيماران سوختگي انجام گرفت. مواد و روش‌ها: اين مطالعه مقطعي از مهر ماه 1392 تا بهمن 1393 در بيمارستان قطب الدين شيرازي انجام شد. در اين مدت، 253 نمونه زخم سوختگي بيماران بستري از نظر رشد ميكروبي بررسي و باكتري‌هاي پسودوموناس‌آيروژينوزا شناسايي شد. تمامي جدايه‌ها با استفاده از ترادف‌يابي اختصاصي ناحيه مورد مطالعه بررسي شدند. تغييرات موجود در توالي با الگوي حساسيت دارويي جدايه‌ها نسبت به داروي ايمي‌پنم مقايسه گرديد. يافته ها: شيوع باكتري پسودوموناس آيروژينوزا در مركز سوختگي شيراز %22 بود. بيش از %90 پسودوموناس‌آيروژينوزاها مقاوم چند دارويي بودند و تنها %25 آن‌ها حساسيت به ايمي پنم داشتند. بيش از %80 نمونه‌هاي مقاوم به ايمي‌پنم از نظر ترادف يابي تغيير در ساختار ژن مرتبط با پروتيين OprD داشتند. نتيجه گيري: با توجه به يافته‌ها، به نظر مي‌رسد پسودوموناس آيروژينوزا به عنوان ميكروارگانيسم شايع در زخم بيماران سوختگي، داراي تغيير در ساختار ژنومي پورين پروتيين ديواره اي OprD است. اين امر مي تواند در بروز مقاومت اين باكتري در بيماران بستري نقش داشته باشد.

Background: Drug resistance is one of the important threats in uncontrolled infections by Pseudomonas aeruginosa, an opportunistic nosocomial pathogen, in burn patients. The presence of OprD porin protein in the bacterial cell wall is one of the mechanisms for resistance against hydrophilic drugs in this bacterium. Objective: The aim of this study was to evaluate genetic sequence rearrangements of OprD gene in imipenem resistant clinical isolates of pseudomonas aeruginosa in burn patients. Methods: This cross sectional study was performed in Ghotbeddin Shirazi Hospital from October 2013 to February 2015. A total of 253 wound samples were evaluated for Pseudomonas aeruginosa. All isolates were evaluated using specific sequencing of the target region. Genetic sequence rearrangements were compared with the sensitivity pattern of the isolates to the imipenem. Findings: Pseudomonas aeruginosa was found in 22% of the samples in Shiraz burn center. More than 90% of the isolates were multi drug resistant while only 25% were sensitive to imipenem. More than 80% of the imipenem resistant isolates had rearrangement in the gene associated with OprD protein. Conclusion: With regards to the results, it seems that Pseudomonas aeruginosa, as a prevalent microorganism in burn wounds, has rearrangement in the gene associated with OprD porin protein. This rearrangement may play a role in drug resistance of the Pseudomonas aeruginosa isolates in hospitalized patients.