مقايسه‌ي تغييرات ژنتيكي لسيتين كلسترول آسيل ترانسفراز بين افراد داراي غلظت سرمي بالا و پايين از ليپوپروتيين با چگالي بالا (HDL) در جمعيت قند و ليپيد تهران

A Comparison of Lecithin Cholesterol Acyltransferase Gene Variation among Individuals with High and Low HDL Levels in Tehran Lipid and Glucose Study (TLGS)

مقدمه: غلظت سرمي پايين ليپوپروتيين با چگالي بالا (HDL) يكي از مهم‌ترين و شايع‌ترين عوامل خطر بيماري‌هاي قلبي ـ عروقي است. بنابراين شناخت ژن هاي موثر بر غلظت HDL سرمي اهميت زيادي دارد. در اين مطالعه، ارتباط بين تغييرات توالي ژن لسيتين كلسترول آسيل ترانسفراز (LCAT) با سطح سرمي كلسترول ـ HDL در جمعيت مطالعه قند و ليپيد تهران (TLGS) مورد بررسي قرار گرفت. مواد و روش-ها: با استفاده از داده هاي فاز 4 مطالعه TLGS، افراد با غلظت كلسترول ـ HDL پايين و افراد با غلظت كلسترول ـ HDL بالا شناسايي شده، در نهايت افرادي از هر گروه كه حداقل يكي از بستگان درجه اول آن‌ها داراي فنوتيپ مورد نظر بودند، وارد مطالعه گرديدند. محدوده سني افراد 15 سال به بالا تعيين و عوامل چاقي، سن، جنس، قند و فشار خون به عنوان عوامل مداخله‌گر در نظر گرفته شدند. تغييرات ژنتيكي ژن LCAT به روش تعيين توالي مستقيم شناسايي و ارتباط آن‌ها با غلظت كلسترول ـ HDL بررسي شد. يافته ها: در مجموع 15 تغيير ژنتيكي شناسايي شدند. دو تغيير ژنتيكي rs5923 و Q177E با فراواني آللي به ترتيب 87/5 درصد و 7/4 درصد در هر دو گروه مورد مطالعه وجود داشتند، هر چند در افراد با غلظت پايين HDL به طور معني داري بيشتر بودند. 11 مورد از تغييرات ژنتيكي براي اولين بار در اين بررسي گزارش شده است و 4 مورد قبلاً در پايگاه داده چندريختي تك نوكليوتيدي (dbSNP) گزارش شده بودند. نتيجه گيري: نواحي اگزوني ژن LCAT در جمعيت تهران داراي تغييرات ژنتيكي متعددي مي‌باشد. اگرچه فراواني تعدادي از آن‌ها در افراد با كلسترول ـ HDL سرمي پايين، بيشتر بود، اما پس از تعديل با عوامل مداخله‌گر، از نظر آماري معني دار نبود.

Introduction: Disturbances in blood lipids levels are considered an important risk factor for cardiovascular diseases. Low serum level of HDL-C is one of these disturbances. Therefore, identifying the genes effective on HDL levels is very important. The present study investigated the relationship between LCAT gene sequence alterations and serum levels of HDL-C. Materials and Methods: Using the data of phase 4 of the TLGS study, individuals with low serum HDL-C and individuals with high serum HDL-C were identified and individual aged ?15 from both groups, who had at least one first degree relative with the desired phenotype were finally enrolled in the study. For each Individual confounding factors, including BMI, age, sex, blood sugar and blood pressure, were determined. LCAT gene variants were determined through direct sequencing, and their relationship with HDL-C level was investigated in the Tehran lipid and glucose study (TLGS). Results: In total, 15 variants were identified. Two variants of rs5923 and Q177E, with allelic frequencies of 5.87% and 4.7%, respectively, were identified in both groups, although, they were significantly higher in the low HDL subjects. Eleven variants were reported for the first time, while 4 variants had already been reported in the SNP database. Conclusions: Exon regions of the LCAT gene in Tehranʹs population have various gene variants. Although the prevalence of a number of single nucleotide variants of this gene was higher in individuals with low serum HDL-C, after adjustment for confounding factors, the difference was not statistically significant.