سنجش ‏فعاليت ‏ضد ‏ميكروبي ‏باكتري‏هاي ‏جداسازي ‏شده ‏از ‏درياي ‏خزر ‏و ‏شناسايي ‏مولكولي ‏سويه‏هاي ‏داراي ‏اثر ‏ضد ‏ميكروبي

Measurement of antimicrobial activity of isolated bacteria from the Caspian sea and molecular identification of strains with antimicrobial effect

مقدمه: ‏دسترسی ‏آسان ‏و ‏استفاده ‏گسترده ‏از ‏تركیبات ‏ضد ‏میكروبی، ‏به ‏پیدایش ‏مقاومت ‏در ‏میان ‏میكروارگانیسم‏ها ‏منجر ‏شده ‏است. ‏بنابراین، ‏غربال‏گری ‏و ‏شناسایی ‏تركیبات ‏ضد ‏میكروبی ‏با ‏اثر ‏بخشی ‏بالا ‏از ‏میكروارگانیسم‏های ‏ساكن ‏در ‏محیط‏های ‏مختلف ‏امری ‏ضروری ‏است. ‏استفاده ‏از ‏میكروارگانیسم‏ها ‏برای ‏اهداف ‏زیست ‏شناختی، ‏آن‏ها ‏را ‏به ‏عنوان ‏یك ‏ابزار ‏مؤثر ‏برای ‏كنترل ‏پاتوژن‏ها ‏تبدیل ‏كرده ‏است. ‏یكی ‏از ‏این ‏میكروارگانیسم‏ها، ‏باكتری ‏استرپتومایسس ‏گریزئوس ‏است. ‏هدف ‏از ‏مطالعه ‏حاضر، ‏جداسازی ‏باكتری‏های ‏آبزی ‏با ‏اثر ‏ضد ‏میكروبی ‏بر ‏پاتوژن‏های ‏مقاوم ‏گرم ‏مثبت ‏و ‏گرم ‏منفی ‏و ‏در ‏نهایت، ‏شناسایی ‏مولكولی ‏سویه‏های ‏دارای ‏اثر ‏ضد ‏میكروبی ‏است. ‏ مواد ‏و ‏روش‏ها: ‏در ‏مطالعه ‏حاضر، ‏162 ‏سویه ‏از ‏دریای ‏خزر ‏جداسازی ‏شد. ‏پس ‏از ‏كشت ‏روی ‏محیط ‏اختصاصی ‏میكروب‏ها، ‏خاصیت ‏ضد ‏میكروبی ‏باكتری‏های ‏آبزی ‏روی ‏سویه‏های ‏مرجع، ‏سنجیده ‏شد. ‏4 ‏سویه ‏كه ‏بیش ‏ترین ‏خاصیت ‏ضد ‏میكروبی ‏را ‏داشتند ‏انتخاب ‏و ‏با ‏روش ‏واكنش ‏زنجیره‏ای ‏پلیمراز ‏و ‏تعیین ‏توالی ‏ژن ‏S ‏rDNA16 ‏به ‏عنوان ‏سویه ‏جدید ‏شناسایی ‏و ‏در ‏بانك ‏اطلاعات ‏ژنی ‏NCBI ‏ثبت ‏شد. ‏ نتایج: ‏از ‏مجموع ‏162 ‏نمونه ‏جداشده، ‏4 ‏باكتری ‏بیش ‏ترین ‏فعالیت ‏آنزیمی ‏را ‏داشتند، ‏نتایج ‏سنجش ‏فعالیت ‏ضد ‏میكروبی ‏آن‏ها ‏نشان ‏دادكه ‏بیش‏ترین ‏اثر ‏ضد ‏میكروبی ‏را ‏روی ‏استافیلوكوكوس ‏اورئوس ‏و ‏باسیلوس ‏سوبتیلیس ‏و ‏كم ‏ترین ‏اثر ‏را ‏روی ‏اشریشیاكلی ‏و ‏سودوموناس ‏آئروجینوزا ‏داشتند. ‏در ‏انتها، ‏پس ‏از ‏تعیین ‏توالی ‏ژنی ‏باكتری‏های ‏دارای ‏اثر ‏ضد ‏میكروبی، ‏مشخص ‏شد ‏كه ‏سویه‏ها ‏به ‏استرپتومایسس ‏گریزئوس ‏متعلق ‏هستند. ‏ بحث ‏و ‏نتیجه ‏گیری: ‏در ‏مطالعه ‏حاضر ‏4 ‏سویه ‏باكتریایی ‏دارای ‏اثر ‏ضد ‏میكروبی ‏شناسایی ‏شد. ‏با ‏توجه ‏به ‏قدرت ‏این ‏سویه‏ها ‏در ‏كنترل ‏رشد ‏باكتری‏های ‏پاتوژن ‏مقاوم ‏به ‏آنتی‏بیوتیك ‏می‏توان ‏با ‏خالص‏سازی ‏‏بیشتر ‏مواد ‏ضد ‏میكروبی ‏این ‏میكروارگانیسم‏ها ‏در ‏شرایط ‏بهینه ‏و ‏كنترل ‏شده، ‏در ‏صنایع ‏دارویی ‏و ‏برای ‏درمان ‏پاتوژن‏های ‏خطرناك ‏از ‏آن‏ها ‏استفاده ‏كرد. ‏

Introduction: Easy access and wide use of antimicrobial compounds led to the emergence of resistance among microorganisms. Therefore, screening and identifying antimicrobial compound with high effect of microorganisms in different environments is necessary and vital . Using microorganisms for biological aims change them to an important tool to control pathogens. Streptomyces griseus is one of them. The aim of this study is isolation of marine bacteria with antimicrobial effect against gram positive and negative bacteria. Finally, molecular identification of strains with antimicrobial activity. Materials and methods: In this study, 162 strains were isolated from the Caspian Sea .The strains were cultured on special medium and finally antimicrobial activity on references strains as measured. Among them four strains with remarkable antimicrobial activity were identified and selected. The strains were subjected to 16S rDNA PCR sequencing. The strains were submitted to NCBI as new Streptomyces griseus strains. Results: Among 162 strains, 4 strains had the most antimicrobial activity. The result showed, the strains were the most effective on Bacillus subtilis and Staphylococcus aureus (Gram positive bacteria) and the least effect were observed on Escherichia coli and Pseudomonas aeruginosa (Gram negative bacteria). After sequencing, the strains were classified to sterptomyces griseus genu. Discussion and conclusion: In this study, 4 strains with antimicrobial activity were identified. According to the strength of these bacteria for controlling pathogenic bacteria resistant to antibiotic, we can have more pure microorganisms in optimized and controlled conditions for using in pharmaceutical industries and also for the treatment of dangerous pathogenic bacteria.