آناليز ترانسكريپتوم ژن‌هاي القاء شده در پاسخ به تنش شوري در گياه شورپسند Aeluropus littoralis

Transcriptom Analysis of Induced Genes in Response to Salt Stress in the Halophyte Aeluropus littoralis

شوری خاك با محدود كردن تولیدات گیاهی ابتدا جنبه‌های نموی را تحت تأثیر قرار می‌دهد كه منجر به كاهش تولیدات گیاهی می‌گردد. در این تحقیق آنالیز بیان ژن مبتنی بر تكنیك cDNA-AFLP جهت مقایسه الگوی بیانی ناشی از تنش شوری در سه سطح 0 (شاهد)، 200 و 400 میلی‌مولار NaCl به‌مدت 1 هفته پس از واكشت، در ریشه گیاه Aleuropus littoralis كه نزدیك­ترین خانواده به غلات می­باشد، انجام شد. از میان 32 عدد EST  جداسازی شده از روی ژل پلی‌اكریل‌آمید، 25 عدد با طول میانگین 250 جفت باز توالی‌یابی شدند. به‌میزان 80% از رونوشت­های توالی‌یابی شده با توالی اسیدآمینه و اسیدنوكلئیك شناسایی شده در موجودات دیگر، شباهت نشان دادند. از طرفی دیگر، 7 رونوشت (EST) به‌عنوان ژن­های جدید احتمالی در نظر گرفته شدند. در نهایت 25 عدد EST  در بانك ژن به ثبت رسید كه مهم‌ترین آنها شامل گروه­های پروتئینی انتقال‌دهنده پتاسیم، پروتئین­های ریبوزومی، NADH­ دهیدروژناز و گولگین می­باشند. نتایج این تحقیق در درك پایه­های مولكولی تنش شوری و مكانیسم مقاومت جهت اصلاح و مهندسی ژنتیك در بهبود مقاومت غلات در برابر این تنش و تولید گیاهان مقاوم كمك می‌كند.  

Soil salinity limits crop production and affects developmental aspects at first Leading to reduced plant production. In this study, gene expression analysis based on cDNA-AFLP technique was used to compare the expression profiles of NaCl stress at three levels, 1 week after subculture: 0 (control), 200mM and 400mM, in roots of Aeluropus littoralis which is the closest family to cereal. Among 32 isolated ESTs, 25 ESTs were obtained with the average length of 250 bp. The nucleotide sequences were compared with those in the GenBank database. Approximately 80% of the ESTs show homology to nucleotide or amino acid sequences in the GenBank database and 7 ESTs show no significant similarity in the GenBank database which considered as novel genes. Finally, 25 ESTs were recorded in NCBI database which are included potassium transporter, ribosomal protein, NADH dehydrogenase and golgin. The result of this research is very important to understand molecular basis and resistance mechanisms of drought stress for breeding and genetic engineering to improve crop resistance against stress and the production of resistant plants.