شناسايي QTLهاي كنترل‌كننده صفات مرتبط با كيفيت پخت و تبديل در يك جمعيت F2:4 برنج

Identification of QTLs Controlling Cooking and Milling Quality Traits in an F2:4 Population of Rice (Oryza sativa L.)

در اين پژوهش، از جمعيتي متشكل از 196 خانواده F2:4 حاصل از تلاقي دو رقم اصلاح شده و بومي ايراني به اسامي سپيدرود و غريب جهت شناسايي QTL‌هاي صفات مرتبط با كيفيت پخت دانه و تبديل شلتوك استفاده شد. وجود چندشكلي بين والدين در 550 نشانگر ريزماهواره (SSR) و ده تركيب آغازگر از نشانگر هاي AFLP بررسي و سپس نقشه پيوستگي جمعيت بر اساس داده‌هاي ژنوتيپي 216 نشانگر چندشكل (105 نشانگر SSR و 111 نشانگر AFLP) تهيه شد. نقشه حاصل 3/1861 سانتي‌مورگان از ژنوم برنج را پوشش داد و فاصله متوسط بين نشانگرها 95/8 سانتي‌مورگان بود. نتايج حاصل از مكان‌يابي فاصله‌اي مركب در مجموع تعداد بيست و هشت QTL براي اين صفات شناسايي نمودكه تعدادي از QTLهاي شناسايي شده كنترل بيش از يك صفت را بر عهده داشتند. براي هر يك از صفات مورد مطالعه يك يا چند QTL كوچك ‌اثر به همراه حداقل يك QTL بزرگ ‌اثر كه سهم زيادي از تنوع فنوتيپي صفت را كنترل مي‌كردند، شناسايي شد. QTLهاي بزرگ‌ اثر كنترل‌كننده صفات مورد نظر و نشانگرهاي پيوسته با آنها مي‌توانند در برنامه‌هاي انتخاب به كمك نشانگر مورد استفاده قرار گيرند.

In Present research, 196 F2:4 families from the cross between two Iranian local and improved rice varieties, Sepidrood and Gharib, were used to identify QTLs controlling cooking and milling quality traits. The polymorphism between parents was evaluated by 550 SSR markers and 10 primer combinations of the AFLP markers and linkage map was constructed by 216 polymorphic markers (105 SSRs and 111 AFLPs). The map covered 1861.3 cM of the rice genome with an average distance of 8.95 cM between markers. QTL analysis by composite interval mapping identified 28 QTLs for the studied traits, which some QTLs controlled more than one trait. Furthermore, one major QTL explaining high percentage of the phenotypic variance together with one or several minor QTLs were identified for each studied traits. The major QTLs controlling the studied traits and their linked markers can be considered as selectable markers for marker assisted selection (MAS) programs.