چندشكلي اگزون 2 ژن BMP15 در گوسفند سنگسري ايران

Polymorphism in exon2 of BMP15 gene in Iranian sangsari sheep

نرخ باروری یكی از صفات مهم اقتصادی در گوسفند است، كه تحت تأثیر محیط و ژنتیك می¬باشد. تا¬كنون سه دسته ژن مؤثر بر این صفت شناخته شده است، یكی از آنها خانواده BMP ها می¬باشد كه معروفترین آن BMP15 است. جهش¬های مختلف در ژن BMP15 راندمان صفات تولید مثلی و رشد در گوسفند را افزایش می¬دهد. هدف از این مطالعه بررسی ژنتیكی و فیلوژنتیكی توالی نوكلئوتیدی این ژن در گوسفند نژاد سنگسری ایران می-باشد. نمونه های خون از تعداد ۲۰ رأس گوسفند نژاد سنگسری ایستگاه پرورش و اصلاح نژاد دامغان جمع¬آوری شد. پس از استخراج DNA، تكثیر قطعه 222 جفت بازی اگزون شماره 2 ژن BMP15 با استفاده از واكنش زنجیره¬ای پلیمراز انجام شد و سپس نمونه ها توالی یابی شدند. نتایج آنالیز توالی¬ها حاكی از وجود چهار هاپلوتایپ و سه جهش معنی دار در ژن مذكور بود. كه یكی از این جهش¬ها، برای اولین بار در ژن BMP15 گوسفند گزارش می¬شود. همچنین به منظور تعیین فاصله ژنتیكی حدود 103 توالی از ژن مذكور حیوانات مختلف و نژادهای مختلف گوسفند گرداوری شد. سپس درخت فیلوژنتیكی رسم و فواصل ژنتیكی و میزان اختلاف نوكلئوتیدی محاسبه گردید. نتایج آزمون فیلوژنتیكی نشان داد كه بز، گاو و گاومیش كمترین فاصله ژنتیكی و میمون، انسان و موش بیشترین فاصله را با گوسفند سنگسری دارا می¬باشند. همچنین آنالیز فیلوژنتیكی بین نژادهای گوسفند حاكی از عدم اختلاف ژنتیكی بین نژادهای بومی هندی و كشمیری با نژاد سنگسری ایران بود.

Fertility rate is an economically important trait in sheep, which is influenced by genetic and environment. So far, three genes have been identified that affects this trait, one of them would be the BMP family, the most famous one is BMP15. Different mutations in the BMP15 gene, increases reproductive performance and growth rate in sheep. The aim of this study was to investigate the genetic and phylogenetic of BMP15 gene sequence in Iranian Sangsari sheep. For this purpose, the blood samples from 20 animal of Damghan station were collected. After DNA extracting, a segment of 222 bp of exon 2 of BMP15 gene was amplified using polymerase chain reaction. Then, all of the PCR products were sequenced. The results showed existence of four haplotypes and three significant mutations of the gene that which one of them was seen for first. In order to determine the genetic distance of Sansari sheep with other animals especially sheep breeds about 103 sequences were taken from Genebank, Then, phylogenetic trees were drawn. Genetic distances and nucleotide differences were calculated. The results showed that goat, cattle and buffalo have minimum genetic distance and monkey, human and mouse have maximum distance with Sangsari sheep and native Hindi and Kashmiri sheep have not any differences with Iranian Sangsari sheep.