شناسايي ويروس موزائيك كلم گل با روش‌هاي سرولوژيكي و مولكولي در استان‌‌هاي خراسان رضوي و شمالي

Detection of Cauliflower mosaic virus by Serological and Molecular Methods in Northern and Razavi Khorasan Provinces of Iran

ویروس موزائیك كلم گل عضو تیپ جنس Caulimovirus از خانواده Caulimoviridae می‌باشد. این ویروس با ژنوم دی ان ای حلقوی دو رشته‌ای یكی از مهم‌ترین ویروس‌های خسارت‌زای خانواده كروسیفر می‌باشد. به منظور شناسایی ویروس موزائیك كلم گل (4(CaMV، در تابستان سال‌های 1390-1389 از مناطق كشت كلم گل در استان‌های خراسان رضوی و شمالی تعداد 343 نمونه مشكوك به آلودگی جمع‌آوری شد. آلودگی نمونه‌ها با كمك روش سرولوژیكی 5DAS-ELISA و با استفاده از آنتی‌سرم پلی كلونال تعیین شد. جهت تایید آلودگی نمونه‌ها با استفاده از جفت آغازگرهای اختصاصی یك قطعه از ژنوم به اندازه 1400 جفت باز واقع در ناحیه پروتئین پوششی به روش 6PCR تكثیر شد. محصولات PCR تعیین توالی شدند و اطلاعات حاصل از آن با سایر جدایه‌های موجود در بانك ژن مقایسه گردیدند. رسم درخت فیلوژنی برای ژن پروتئین پوششی CaMV با استفاده از نرم افزار MEGA5 و بكارگیری روش Neighbour joining نشان داد كه جدایه‌های ایرانی زیر گروه مستقلی را تشكیل داده و همراه با جدایه هایی از چین و مجارستان در گروه جدایه‌های غیر آمریكای شمالی و مجزا از گروه جدایه‌های آمریكای شمالی قرار می‌گیرند.

Cauliflower mosaic virus is a type member of Caulimovirus from Caulimoviridae family that has double stranded DNA genome and is one of the most destructive viruses of cruciferous plants. In order to detect cauliflower mosaic virus in some areas of Iran under the cultivation of cauliflower, 343 symptomatic leaf samples of cauliflower were collected from Northern and Razavi Khorasan provinces of Iran in summer 2009-2010.To detect CaMV infection, collected plants were tested by DAS-ELISA. Polymerase chain reaction (PCR) using CaMV-specific primers (CMcp-F1\CMcp-R1) for ORF IV genes of CaMV was used for confirmation of infection. A 1400 bp fragment were amplified by PCR and then sequenced. Iranian isolates were compared with other isolates of CaMV deposited in the gene bank. The phylogenic trees of the coat protein genes of CaMV were drown by MEGA5 software using neighbor joining method. The results showed that the Iranian isolates clustered with Chinese and Hungarian isolates in a different clade from North- American isolates.