تنوع گونه هاي نوكاردياهاي بيماري زا جدا شده از بيماران

Species spectrum of pathogenic Nocardia isolated from patients

سابقه و هدف:به طور سنتي Nocardia asteroides گونه غالب مسبب نوكارديوز در نظر گرفته ميشود. شناسايي ايزوله ها بدست آمده با استفاده از تكنيك هاي مولكولي نشان ميدهند كه جنس ها در معرض پيچيدگي طبقه بندي قابل توجه اي قرار دارند و شناسايي پايه فنوتيپي مي تواند مبهم باشد. هدف از اين مطالعه بررسي توزيع گونه هاي نوكارديا سويه هاي عمدتا بهبود يافته از بيماران مشكوك به سل، در طول دوره سه ساله بود (1388-1391). مواد و روش ها: ايزوله هاي باليني در سطح گونه با استفاده از تست هاي فنوتيپيك و روش ژنوتيپي شامل تجزيه و تحليل توالي هاي تك و چند ژني (MLSA) از ژن gyrB , 16S rRNA و secA1 شناسايي شدند. يافته ها:نوكارديوز در اين مطالعه در 46 بيمار تشخيص داده شد. شايع ترين حالت زمينه اي پيوند عضو (6 نفر؛ 13?)، سرطان (6 نفر؛ 13?)، ويروس نقص ايمني انساني (HIV) (6 نفر؛ 13?)، بيماري هاي ريوي مزمن غير عفوني(5 نفر؛10.8 ?) و سل (4 نفر؛ 8.7?) شد. درگونه هاي نوكارديا بدست آمده از 46 نمونه مختلف باليني، شايع ترين نوع لاواژ برونكوآلويولار (BAL) (43.5?) بود. يازده گونه مختلف از نوكارديا از بيماران شناسايي شد: asteroides N. (12 ايزوله) ، cyriacigeorgica N. (9 ايزوله) ، farcinica N. (7 ايزوله) ، wallacei N. (6 ايزوله) ، N. carnea (3 ايزوله) ، N. otitidiscaviarum (3 ايزوله) ، N. abscessus (1 ايزوله) ، N. arthritidis (1 ايزوله) ، N. kruczakiae (1 ايزوله) ، N.nova( 1ايزوله) و N. veteran ( 1ايزوله). نتيجه گيري: عفونت ناشي از گونه هاي نوكارديا به نظر مي رسد شايع تر از انتظار عمومي باشد.مطالعه حاضر شواهد بيشتري را ارايه مي كند كه گونه هاي نوكارديا قادر به ايجاد طيف گسترده اي از بيماري هاي انساني در افراد سالم و بيماران داراي نقص ايمني هستند. MLSA يك روش قابل اعتماد براي شناسايي گونه هاي دقيق از نوكاردياهاي ايزوله شده است و براي استفاده هاي معمول در آزمايشگاه باليني بيشتر امكان پذير خواهد بود.

Aim and background:Traditionally Nocardia asteroides was considered the predominant species of causing nocardiosis. The improved identification of isolates using molecular techniques have shown that the genus exhibits considerable taxonomic complexity and phenotypic base identification can be ambiguous. The aim of this study was to assess the species distribution of Nocardia strains mostly recovered from patients suspected of having tuberculosis, during three years period (2009-2012). Material and methods:The clinical isolates were identified to species level using conventional tests and genotypic methods using single and multi locus sequence analysis (MLSA) of 16S rRNA, gyrB and secA1 genes. Nocardiosis was diagnosed in 46 patients. Results:The most frequent underlying condition were organ transplantation (6 patients; 13%), cancer (6 patients; 13%), human immunodeficiency virus (HIV) (6 patients; 13%), non-infectious chronic lung disease (5 patients; 10.8%) and tuberculosis (4 patients; 8.7%). Nocardia species was recovered from 46 different clinical specimens, the most common of which was bronchoalveolar lavage (BAL) (43.5%). Eleven different Nocardia species were identified: N. asteroides (n=12), N. cyriacigeorgica (n=9), N. farcinica (n=7), N. wallacei (n=6), N. carnea (n=3), N. otitidiscaviarum (n=3), N. abscessus (n=1), N. arthritidis (n=1), N. kruczakiae (n=1), N. nova (n=2) and N. veterana (n=1). Conclusion:In conclusion, infection caused by Nocardia species appears to be more common than is generally appreciated. The current study provides further evidence that Nocardia species are capable of causing a wide range of human diseases in healthy and immunocompromised patients. MLSA is a reliable method for accurate species identification of Nocardia isolates and would be more feasible for routine use in clinical laboratories.