بررسي ارتباط پلي‌مورفيسم ناحيه ’UTR٣ ژن اوروكيناز با احتمال ايجاد سنگ‌هاي كلسيمي كليه

Association between polymorphism at 3׳UTR of urokinase gene and risk of calcium kidney stones

زمينه: سنگ‌ كليه يك بيماري چند‌ عاملي شايع در ايران است. عوامل محيطي و ژنتيكي از جمله چند شكلي‌هاي (پلي مورفيسم) تك‌ نوكليوتيدي در بروز سنگ‌ كليه تاثير‌گذارند. هدف: مطالعه به‌ منظور تعيين ارتباط چندشكلي T/C در نوكليوتيد 4065+ ناحيه غيرترجمه‌شونده ’UTR3 (?untranslated region3) ژن اوروكيناز (rs) 4065 با احتمال ايجاد سنگ‌هاي كلسيمي كليه انجام شد. مواد و روش‌ها: اين مطالعه مورد- شاهدي در سال ?3?? بر روي 70 فرد با سابقه سنگ‌ كليه از نوع كلسيمي و 70 فرد سالم به ‌عنوان گروه شاهد در بيمارستان بقيه الله(عج) تهران انجام شد. چند ‌شكلي با روش (AS-PCR) Allele specific PCR بررسي شد. فراواني آللي و ژنوتيپي افراد با استفاده از جداول احتمالي و آزمون تعادل هاردي‌ واينبرگ دو گروه با آزمون آماري كاي‌ دو مقايسه شدند. يافته‌ها: در ميان70 فرد بيمار 10 نفر (%‌??) براي چند شكلي ژن اوروكيناز هتروزيگوت و ?? نفر (%??) هموزيگوت بودند. ?? نفر از افراد شاهد (%3?) براي اين چند شكلي هتروزيگوت بودند. فراواني آلل T در افراد بيمار %4? و در گروه شاهد %?? بود. فراواني آلل C در افراد بيمار %?? و در گروه شاهد %?? بود. كسر برتري (Odds ratio) نشان داد خطر ابتلا به سنگ‌هاي كلسيمي كليه در افراد حامل اين آلل 7/? برابر بيش‌تر از افراد غير‌حامل بود. نتيجه‌گيري: با توجه به يافته‌ها، به نظر مي رسد بين چند شكلي ناحيه ’UTR3 ژن اوروكيناز و ايجاد سنگ ‌كليه كلسيمي ارتباط معني‌دار قابل توجهي وجود دارد. احتمالاً چند شكلي ژن اوروكيناز مي‌تواند به ‌عنوان يك ژن كانديد موثر در بروز سنگ‌ كليه كلسيمي معرفي شود. كليدواژه‌ها: چند شكلي‌هاي (پلي مورفيسم) تك نوكليوتيدي، ناحيه غيرترجمه شونده، واكنش زنجيره اي پليمراز

Background: Kidney stone is a common multifactorial disease in Iran. Environmental and genetic factors including single nucleotide polymorphism (SNP) affect the incidence of kidney stones. Objective: The aim of this study was to determine the association of +4065 T/C polymorphism at 3?untranslated region (3ʹUTR) of urokinase gene and calcium kidney stones. Methods: This case-control study was conducted on 70 patients with history of calcium kidney stones as case group and 70 healthy subjects as control group in the Baqiyatallah hospital in 2013. The polymorphism was assessed using the Allele Specific PCR (AS-PCR) method. Allele and genotype frequencies of the two groups were compared using 2x2 contingency tables. Hardy-Weinberg equilibrium was compared between the two groups using Chi-square test. Findings: Of 70 cases, 10 (15%) were heterozygous and 24 (34%) were homozygous for the polymorphism. Of 70 controls, 25 (35%) were heterozygous for the polymorphism. The frequency of mutant T allele was 41% in the case group and 18% in the control group. The frequency of mutant C allele was 59% in the case group and 82% in the control group. The risk of calcium kidney stones in carriers of the mutant allele was 1.7 times higher than non-carriers (OR: 1.7). Conclusion: With regards to the results, it seems that there is a significant association between the polymorphism at 3?UTR of urokinase gene and formation of calcium kidney stones. Urokinase gene polymorphism may be introduced as a candidate gene involved in calcium stone formation.‌ Keywords: Single Nucleotide Polymorphism, 3ʹ Untranslated Regions, Polymerase Chain Reaction