بررسي اپيدميولوژي مولكولي جدايه‌هاي گاوي گوسفندي و بزي مايكوباكتريوم پاراتوبركلوزيس موجود در بانك ميكروبي موسسه تحقيقات واكسن و سرم‌سازي رازي با استفاده از روش

Molecular epidemiology of bovine, ovine and caprine Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis field isolates archived at Razi Vaccine & Serum Research Institute by Short Sequence Repeats (SSR) analysis

مایكوباكتریوم آویوم زیرگونه پاراتوبركولوزیس (MAP) در نشخواركنندگان عامل ایجاد پاراتوبركولوزیس می‌باشد كه بدلیل تحمیل خسارت‌های اقتصادی گسترده از اهمیت اقتصادی زیاد برخوردار می‌باشد. در سال‌های اخیر استفاده از توالی‌های تكراری كوتاه در ژنوتایپینگ این باكتری مورد توجه قرار گرفته است. در مطالعه حاضر نتایج حاصل از كاربرد این روش با اتكا بر روی 2 لوكوس SSR8 و SSR9 بر روی 3 جدایه كلینیكی و 1 سویه مرجع مورد بررسی قرار گرفته است. سه جدایه ایرانی گاوی، گوسفندی و بزی همراه با یك سویه آزمایشگاهی به نام MAP III & V در بررسی وارد شدند. از آزمایش‌های PCR-F57 و PCR-IS900 برای تعیین هویت همه باكتری‌های تحت بررسی استفاده شد. بر اساس روش پیشنهادی Amonsin همه باكتری ها با تمركز بر دو لوكوس SSR8 و SSR9 ژنوتایپینگ SSR گردیدند. در هر یك از دو لوكوس SSR8 و SSR9 در میان باكتری‌های تحت بررسی دو الل شناسایی گردید بطوریكه كه در SSR8 آلل بزرگتر بطول bp781 و الل كوچكتر با bp778 و در SSR9 دو الل bp581 و bp578 شناسایی گردیدند. دو جدایه گاوی و گوسفندی MAP همراه با سویه آزمایشگاهی دارای یك الگوی مشابه بودند در حالیكه سومین جدایه (بزی) یك تیپ منفرد متفاوت از خود نشان داد. مشاهده دو سویه در بین سه جدایه ایرانی تحت بررسی احتمالا می‌تواند نشانه وجود سطح قابل توجهی از تنوع ژنتیكی این باكتری در ایران باشد اما اثبات این فرضیه نیازمند انجام مطالعات تكمیلی خواهد بود.

Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis (MAP) is the ethiological agent of paratuberculosis in ruminants leading to exensive economical loss. Recently, application of Short Sequence Repeat (SSR) anylsis in genotyping of MAP, has come to attention. In the present work results from application of a two-locus (SSR8 & SSR9) SSR typing system on three Iranian field and one laboratory strain have been addressed. Three Iranian field and one laboratory strain were incorporated in the study. Identification of these as MAP was achieved through F57-PCR and IS900-PCR. The Amonsin version of SSR typyng system was conducted on the bacteria under study using SSR8 and SSR9 loci. Either of the SSR8 and SSR9 produced two alleles. A larger allel of 781 bp and a smaller allele of 778 bp at SSR8 and two alleles of 581 and 578 bp long at SSR9. A single SSR8/SSR9 pattern was shared by the bovine and ovine MAP isolates plus the laboratory strain while the caprine isolate represented a different type. If Iran holds a heterogenous MAP population , we assume detection of at least two SSR types in this work is a likely reflection of such diversity but how extensive such diversity might be further studies are required.