توالي‌يابي ناحيه اگزون سوم ژن IGF1 در گوسفند

Sequencing of third exon of IGF1 gene in sheep

فاكتور رشد شبه انسولين (IGF1) پپتيدي تك زنجيره با وزن مولكولي ?/? كيلو دالتون است. اين فاكتور داراي فعاليتي شبيه انسولين بوده و مهمترين فاكتور رشد در بدن مي باشد كه نقش مهمي در تكثير، تمايز و رشد سلول ها دارد. ژن IGF1 در گوسفند روي كروموزوم شماره ? قرار دارد. اين ژن بيشتر به عنوان يك ژن منتخب براي پيش‌بيني رشد و صفات كيفي گوشت در برنامه هاي بهبود ژنتيكي حيوانات مطرح است. هدف از اين تحقيق، يافتن چند شكلي در ناحيه اگزون سوم ژن IGF1 در گوسفند بود. در اين پژوهش از تعداد 25 راس گوسفندان نژاد مهربان، قره‌گل، قزل، لك‌قشقايي و بهميي به طور تصادفي با تيوب هاي حاوي EDTA خونگيري شد. پس از استخراج DNA، ناحيه اگزون سوم توسط آغازگر هاي اختصاصي با روش PCR تكثير و تعيين توالي گرديد. نتايج نشان داد كه دو چندشكلي در اينترون دوم و سوم وجود دارد. همچنين ساختار پروتيين ژن IGF1 با استفاده از نرم افزار Swiss-pdb viewer و VMD مورد بررسي قرار گرفت. نتايج اين بررسي نشان داد كه اين ژن داراي سطح بالايي از حفاظت‌شدگي تكاملي است و اين پروتيين داراي ساختاري متشكل از مارپيچ‌هاي نامنظم آلفا مي باشد.

Insulin-like growth factor is a single-chain polypeptide. The Molecular weight of it is 7.5 KDa. This factor is insulin like activity and the most important growth factor in the body and plays important role in the proliferation, differentiation and cells growth. IGF1 gene located on chromosome 3 in sheep. This gene is more proposed as a candida gene for growth and meat quality traits in animal genetic improvement programs. The aim of this research is to find Polymorphisms in the third exon. In this research blood samples of breeds of 25 sheep include Mehraban, Karakul, Ghezel, Lak Ghashghaei and Bahmaei were collected with EDTA tube. The DNA was extracted from blood samples and the third exon region was amplified with specific primers using PCR and sequencing. The results showed, there is 2 SNP in intron 2 and 3. Protein structure of IGF1 gene is investigated by using Swiss-pdb viewer software. Protein structure analysis showed that this protein is highly conserved of evolution. This protein has a structure consisting of an alpha helix with irregular structure.