بررسي تنوع ژنتيكي اكوتيپ‏هاي رازيانه با استفاده از نشانگرهاي ISSR و RAPD

Assessment of genetic diversity of fennel ecotypes using RAPD and ISSR markers

رازيانه بعنوان يك گياه معطر و دارويي از زمان‏هاي بسيار دور توسط كشاورزان در مناطق مختلف ايران با اقليم هاي متفاوت كشت و كار مي‏گردد. در اين تحقيق، تنوع ژنتيكي 32 اكوتيپ رازيانه توسط دو نشانگر RAPD و ISSR مورد ارزيابي قرار گرفت. نشانگر RAPD در مجموع 106 قطعه چند شكل و توسط نشانگر ISSR ، 72 قطعه چند شكل تكثير شد. باتوجه به داده‏هاي آغازگر RAPD و ISSR ميانگين تنوع ژني با استفاده از شاخص ني (h) برابر با 3739/0 و 2944/0 و با استفاده از شاخص اطلاعاتي شانون (i) برابر 552/0 و 4563/0 بدست آمد. ميانگين محتواي چندشكلي (PIC) بدست آمده براي نشانگرهاي RAPD و ISSR به ترتيب 4274/0 و 4192/0 برآورد گرديد. در گروه‏بندي انجام شده براساس نشانگر RAPD اكوتيپ‏هاي مورد مطالعه در 7 و بر اساس نشانگر ISSR در 11 گروه طبقه‏بندي شدند. اين نتايج نشان مي‏دهد كه رازيانه‏هاي ايران داراي تنوع ژنتيكي بالايي هستند و نشانگرهاي RAPD و ISSR به خوبي ژنوتيپ‏هاي رازيانه را براساس توزيع جغرافيايي و تشابهات اقليمي از هم تفكيك نمود. آگاهي از اين تنوع ژنتيكي مي‏تواند اصلاحگران را در برنامه‏هاي اصلاحي به خصوص دورگيري بين اكوتيپ هاي دور، مطالعات تكاملي و طبقه بندي ياري نمايد.

Fennels have long been cultivated as an aromatic and medicinal plant in different regions with different climate in Iran. In this study, the genetic diversity of 32 ecotypes of fennel was assessed by RAPD and ISSR markers. A total of 106 and 72 polymorphic fragments were amplified by RAPD and ISSR markers, respectively. Based on RAPD data, mean genetic diversity were 0.3739 and 0.552 by Nei (h) and Shannonʹs information index (I), respectively. Moreover, mean genetic diversity for ISSR marker were accordingly 0.2944 and 0.4563. The obtained average polymorphism content (PIC) by RAPD and ISSR markers were 0.4274 and 0.2192, respectively. Based on cluster analysis of RAPD and ISSR markers, the ecotypes were grouped in 7 and 11 clusters. These results indicate that the Iranian fennels have high genetic diversity, and RAPD and ISSR markers very well differentiated fennel genotypes based on the geographical distribution and climatic similarities. Understanding the genetic diversity can further help breeders in their breeding programs, especially in hybridization breeding, evolutionary and classifications studies.