همسانه سازي مولكولي ترادف رمزكننده ژن H+- ATPase غشاي پلاسمايي در گراس شورزي Aeluropus littoralis

Molecular Cloning of Plasma Membrane H+-ATPase Coding Sequence from Aeluropus littoralis Halophyte Grass

پمپ پروتوني H+-ATPase يكي از پروتيينهاي مهم موجود در غشاي پلاسمايي گياهان مي باشد كه نقش مهّمي در فيزيولوژي مولكولي پاسخ به تنش ايفا مي كند. گراس Aeluropus littoralis به واسطه مقاومت به برخي از استرسهاي محيطي مثل تنش شوري و عناصر سنگين مدل خوبي براي مطالعه ساختار و عملكرد اين پمپ مي باشد. در اين مطالعه به عنوان نقطه آغاز، ترادف كامل ناحيه كدكننده اين ژن در هالوفيت Aeluropus littoralis شناسايي و همسانه سازي شد. اطلاعات اوليه به دست آمده نشان مي دهد ترادف نوكليوتيدي پمپ پروتوني H+-ATPase غشاي پلاسمايي يك ناحيه ORF كامل به طول bp 2856 مي باشد كه همولوژي معني داري با گونه هاي Sorghum bicolor ، Oryza sativa و Zea mays دارد. همچنين ترادف آمينواسيدي اين ژن، پپتيدي با وزن مولكولي 104567 دالتون متشكل از 951 اسيدآمينه را رمز مي كند كه از نظر نوع و ساختار دامين، بيشترين تطابق را با پروتيينهاي H+-ATPase غشاي پلاسمايي گياهي و قارچي نوع سوم (type III) از خانواده بزرگ پمپهاي ATPase p-type دارد. هم رديفي مقايسه اي ترادف آمينواسيدي ژن H+-ATPase غشاي پلاسمايي گياه Aeluropus littoralis (Alha) برخي گونه ها نشان مي دهد كه جايگزينيهاي نوكليوتيدي نقاط حساس و عملكردي پروتيين را هدف قرار نداده و اين مناطق در توالي مورد بررسي، حفاظت شده باقي مانده اند. در نهايت اين ترادف با شماره دسترسيGI:346230720 در پايگاه داده NCBI ثبت گرديد.

H+-ATPase proton pump is one of the major proteins found in plasma membrane of plants which plays an important role in molecular physiology of stress response. Aeluropus littoralis grass due to resistance to some environmental stresses like salinity and heavy metals is a good model for studying the structure and function of the plasma H+ATPase pump. In this study as a starting point, the complete coding sequence of the gene were identified and cloned from Aeluropus littoralis halophyte. Preliminary data showed that nucleotide sequence of A. littoralis plasma membrane proton pump contains a 2856 bp full-length ORF region that shared a significant homology with Sorghum bicolor, Oryza sativa and Zea mays. Also the predicted peptide of this gene consists of 165 amino acid residues with a molecular weight of 104567 Da which is in terms of domains type and structure, consistent with most plant and fungal plasma membrane H + ATPase protein type III (type III) from a large family pump ATPase p-type. Comparative alignment of amino acid sequence of A.littoralis plasma membrane H+ATPase with some species indicated that nucleotide substitutions did not targeted critical and functional positions of protein and these regions remained conserved. At last the sequence was submitted to GenBank with accession number of GI: 346230720.