شناسايي ژن هاي عامل پاتوژنيسيته در گونه هاي اسهال زاي پاتووارهاي اشريشياكلي جداشده از نمونه هاي باليني به روش Multiplex PCR

Identification of Genes Responsible for Pathogenicity in a Diarrhea-causing Strain of Escherichia coli Pathovars Clinically Isolated Specimens by Multiplex PCR

زمينه و هدف: اشريشياكلي موجب انواع بيماري هاي روده اي و خارج روده اي شده و مهم ترين عامل اسهال كودكان در كشورهاي در حال توسعه مي باشد. هدف از اين مطالعه، تعيين هويت مولكولي پاتووارهاي اشريشياكلي مولد اسهال جداشده از نمونه-هاي باليني به روش Multiplex PCR مي باشد. روش بررسي: در اين مطالعه توصيفي، تعداد 150 نمونه مدفوع اسهالي از بيمارستان هاي غرب شهر تهران جمع آوري و با انجام آزمون هاي بيوشيميايي(TSI, SIM, MR&VP) ، تعداد 55 نمونه اشريشياكلي شناسايي گرديد. جهت شناسايي ژن هاي پاتووار از آزمون PCR چندگانه اي استفاده شد. داده هاي آماري با نسخه 19 نرم افزار SPSS و با استفاده از آزمون آماري توصيفي كروسكال-واليس مورد تجزيه و تحليل قرار گرفت. يافته ها: از مجموع 55 نمونه باليني جهت شناسايي و تاييد ژن هاي مورد مطالعه در اين تحقيق، ژنstx1 در هيچ يك از نمونه ها شناسايي نگرديد. بيشترين توزيع فراواني مربوط به ژن stx2 با 72/12 درصد و كمترين فراواني مربوط به ژن IPaH به ميزان 81/1 درصد گزارش شده است. نتيجه گيري: توزيع فراواني بيشتر ژن stx2 نسبت به ساير ژن هاي مطالعه شده در اين تحقيق را مي توان به عنوان عامل اصلي در ايجاد اسهال ناشي از اشريشياكلي دانست. با روشMultiplex PCR مي توان در كوتاه ترين مدت زمان با ويژگي و حساسيت بالا به حضور ژن هاي بيماري زا پي برد و با درمان مناسب و به موقع از به-وجود آوردن سويه هاي مقاوم و انتقال اين ژن ها در جمعيت هاي انساني جلوگيري به-عمل آورد.

Background and Objectives: Escherichia coli causes intestinal and extra intestinal diseases and is a major cause of diarrhea in children in developing countries. The aim of this study was to determine the molecular identity of pathogenic E.coli isolated from clinical samples by the Multiplex PCR. Subjects and Methods: In this cross-sectional study 150 stool samples collected from hospitals in West Tehran and biochemical tests (TSI, SIM, MR&VP) were used to identify E. coli species. Identification of genes pathovar diarrheal was carried out by use of multiplex PCR assay. Statistical data was performed with SPSS version 19, using (kruskal–Wallis one-way analysis of variance) descriptive statistical analysis . Results: A total of 55 of isolated clinical samples were identify as E. coli. Gene stx1 was not identified in any of the samples. Among the identified genes, the highest frequency of responsible gene was stx2 with 12.72% and the lowest was for IPaH gene with 1.81%. Conclusion: Frequency more Stx2 than other genes gene studied in this research can be seen as a major factor ‎in causing diarrhea caused by E. coli‏.‏‎ Multiplex PCR method can be in the shortest period of time ‎with high specificity and sensitivity to the presence of disease-causing genes discovered and be ‎prevented With appropriate and timely treatment of the creation of resistant strains and ‎transmission of these genes in the human population.‎