تكنيك REP-PCR و تعيين الگوي مقاومت آنتي‌بيوتيكي آنها در بيمارستان شهيد محمدي بندرعباس

rep-PCR Genotyping and Antibiogram Pattern of Clinical Isolates of Pseudomonas aeruginosa in Shahid Mohammadi Hospital, Bandar Abbas, Iran

زمینه و هدف: سودوموناس آئروژینوزا از پاتوژن‌های مهم با مقاومت چند دارویی و عامل عفونت‌های فرصت‌طلب بیمارستانی است. از روش‌های مختلفی، به‌منظور بررسی تنوع ژنتیكی سودوموناس آئروژینوزا استفاده می‌شود. تایپینگ با تكنیك REP-PCR به‌عنوان یك روش كم‌هزینه، سریع با قدرت تمایز بالا معرفی شده است. هدف از این مطالعه تعیین پراكندگی، مقاومت آنتی‌بیوتیكی و ارتباط ژنوتیپی در ایزوله‌های بالینی سودوموناس آئروژینوزا می‌باشد. روش بررسی: این مطالعه به‌صورت توصیفی - مقطعی بر روی 67 سویه كلینیكی            سودوموناس آئروژینوزا در بیمارستان شهید محمدی بندرعباس بین سالهای 1392-1391 انجام شد. شناسایی سویه‌ها براساس تست‌های بیوشیمیایی معمول و الگوی مقاومت آنتی‌بیوتیكی به روش Kirby-Bauer صورت گرفت. شباهت ژنتیكی با تكنیك REP-PCR مورد بررسی قرار گرفت. ارتباط تایپینگ مولكولی و الگوهای حساسیت ضدمیكروبی براساس آزمون پیرسون كای‌مربع تعیین شد. سطح معنی‌داری، 05/0p≤ در نظر گرفته شد. یافته‌ها: نتایج REP-PCR، هفت دسته ژنتیكی با شباهت 76% را نشان داد. شایع‌ترین تیپ‌ها با فراوانی 16 (8/23%)، مربوط به كلاسترهای A و C گزارش شد. بیشترین تنوع و پراكندگی REP تایپ‌ها نیز متعلق به سویه‌های ICU بود. اكثر سویه‌ها از نمونه خلط (8/29%)، جداسازی شدند و بیشتر سویه‌ها به كوتریموكسازول (6/80%)، مقاوم بودند. سیپروفلوكساسین با حساسیت 1/85%، مؤثرترین آنتی‌بیوتیك بود. نتیجه‌گیری: نتایج این مطالعه نشان داد سودوموناس آئروژینوزا متعلق بهREP تیپ A و C، سویه‌های غالب در بیمارستان مورد بررسی بوده‌اند. لذا از آنجا كه مقاومت دارویی در عفونت‌های بیمارستانی، مشكل جدی درمان است؛ اجرای دستورالعمل‌های كنترل عفونت، به‌منظور مهار و كاهش عفونت‌های سودوموناس آئروژینوزا، لازم و ضروری به‌نظر می‌رسد.

Background and Objectives: Pseudomonas aeruginosa is one of the multi-drug resistant pathogens and a cause of opportunistic neusocomial infections. Different methods have been used for investigating genetic diversity of P. aeruginosa. rep-PCR typing has been introduced as a rapid and low-cost method with high discriminatory power. The aim of this study was to investigate distribution, genotypic relatedness, and antibiotic resistance in clinical isolates of P. aeruginosa. Methods: This cross-sectional study was conducted on 67 P. aeruginosa clinical isolates at Shahid Mohammadi Hospital, Bandar Abbas, Iran, between May 2012 and June 2013. Identification of strains and determination of antibiotic resistance pattern were conducted by conventional biochemical tests and Kirby-Bauer method, respectively. Genetic similarity was investigated by rep-PCR. The correlation between molecular types and antimicrobial resistance patterns was determined by Pearsonʹs chi-square test. p≤0.05 was considered to be the level of significance. Results: rep-PCR results exhibited seven genotypic clusters with 76% similarity. Genotypes A and C were the most prevalent types with 16 (23.8%) frequency. ICU had the most distribution and diversity of rep-PCR types. The majority of isolates were obtained from sputum (29.8%). Most isolates were resistant to cotrimoxazole (80.6%) and susceptible to ciprofloxacin (85.1%), as the most effective antibiotic. Conclusion: The result of this study showed that P. aeruginosa rep-PCR types A and C were the predominant strains in the studied hospital. Because drug resistance is considered a serious challenge ahead for treatment of nosocomial infections, it is necessary to implement the guidelines of infection control to reduce P. aeruginosa infections.