تعيين فراواني آلل هاي تيپ هاي آميزشي در جمعيت هاي آلترناريا آلترناتا مركبات جنوب كشور با روش واكنش زنجيره اي پلي مراز

Frequency of mating type alleles in Alternaria alternata isolated from citrus products collected from South of Iran based on PCR

سابقه و هدف: تاكنون فرم جنسي براي گونه آلترناريا آلترناتاگزارش نشده است. اما سطوح بالايي از تنوع ژنتيكي و ريخت شناسي مشاهده شده در بين جمعيت هاي اين قارچ بيانگر وجود مكانيسم هاي ناشناخته و مرموز توليد مثل جنسي است. در قارچ هاي آسكوميستي مشابه با اين قارچ، توليد مثل جنسي توسط يك ژن گاه منفرد به نام MAT1 كنترل مي شود كه داراي دو آلل MAT1-1 و MAT1-2 مي باشند. اين مطالعه با هدف تعيين فراواني و نحوه پراكنش آلل هاي ژن MAT1 در جمعيت قارچ آلترناريا آلترناتا مركبات جنوب كشور انجام شد. مواد و روش ها: در اين مطالعه مقطعي- توصيفي، استخراج DNA با روش CTAB، از ريسه هاي جوان نمونه هاي برگي 45 جدايه قارچ آلترناريا آلترناتا كه قبلاً از گونه ها و ارقام مختلف باغات مركبات جنوب كشور جمع آوري و خالص سازي شده بودند، انجام گرديد. به منظور تعيين تيپ هاي آميزشي، از آغازگرهاي اختصاصي براي تكثير ناحيه هاي MAT1-1 و MAT1-2 در واكنش زنجيره اي پلي مراز استفاده شد. يافته ها: جدايه هاي تيپ هاي آميزشي MAT1-1 و MAT1-2 به ترتيب تكثير قطعات 642 و 882 جفت بازي را داشتند. به طور كلي تيپ هاي آميزشي در اين ناحيه از فراواني مساوي برخوردار نبودند. در مجموع، 16 جدايه داراي تيپ آميزشي MAT1-1 و 29 جدايه داراي تيپ آميزشي MAT1-2 بودند. فراواني هاي تيپ هاي آميزشي در شهرستان هاي مختلف و در گونه هاي مختلف مركبات متفاوت بود. نتيجه گيري: نتايج نشان داد كه در برخي از مناطق جنوب كشور و در برخي از ميزبان ها عوامل ناشناخته اي در القاي مرحله جنسي قارچ آلترناريا آلترناتا دخالت دارند.

Background & Objectives: Sexual stage of Alternaria alternata has not been discovered yet. However, high levels of phenotypic and genetic diversity have been reported in different populations of A. alternata. In other Ascomycetes similar to this species, sexual reproduction is controlled by a single locus, named MAT1, with two alleles MAT1-1 and MAT 1-2. The aims of this research were identification of frequency and distribution of both alleles of MAT1in A. alternata population of citrus collected from South of Iran. Materials & Methods: In this cross-sectional study, DNA was extracted from young mycelia of 45 isolates of A. alternata that previously were collected and isolated directly from different species and cultivars of the citrus plants showing leaf spot disease symptoms in different orchards of Southern region of Iran using CTAB method. Mating types were determined using specific primer sets for MAT1-1 and MAT1-2 idiomorphs and PCR assay. Results: A 642 bp amplicon and a 882 bp amplicon were amplified pecificlly for Mat1-1Mat1-2 isolates, respectively. No equal frequency of both mating type idiomorphs were observed in studied samples. Totally 16 and 29 isolates showed the presence of MAT1-1 and MAT1-2 idiomorphs, respectively. Unequal frequency of both idiomorphs was observed in the citrus species and cultivars collected from different regions. Conclusion: It seems that unknown factors are involved in sexual induction of A. alternata in some regions and citrus hosts in South of Iran.