مقايسه كارآيي نشانگرهاي مولكولي SSR و RAPD در برنامه گزينش به كمك نشانگر (MAS) در برنج

گزارش­هاي متعددي از مقايسه كارآيي نشانگرهاي مولكولي براي برآورد پارامترهاي ژنتيكي گياهان در مطالعات تنوع ژنتيكي منتشر شده است. اغلب تحقيقات بر روي ژنوم­هاي گياهي مختلف و برنامه­هاي اصلاحي گوناگوني انجام گرفته است، ولي در اين ميان گزارشي مبني بر مقايسه كارآيي نشانگرهاي SSR و RAPD در برنامه­هاي گزينش به كمك نشانگر (MAS) در ژنوم برنج مشاهده نشده است. به همين منظور، در اين تحقيق كارآيي دو سيستم نشانگري فوق جهت تخمين برخي پارامترهاي ژنتيكي در لاين­هاي تلاقي برگشتي پيشرفته در برنج مورد مقايسه قرار گرفت. از 100 جفت آغازگر SSR و20 آغازگر RAPD براي انگشت­نگاري ژنوتيپ­ها استفاده شد. چندشكلي نشانگرهاي RAPD بيشتر از نشانگرهاي SSR، اما ميزان اطلاعات چندشكلي نشانگر SSR بيش از دو برابر نشانگر RAPD به دست آمد. همبستگي ضعيفي ميان دو سيستم مختلف نشانگري براي تخمين شباهت ژنتيكي نتاج به والد تكراري مشاهده گرديد. همچنين نتايج نشان داد كه افزايش تعداد نشانگر RAPD تاثيري در افزايش دقت برآوردها نداشت. با توجه نتايج اين تحقيق پيشنهاد مي­شود كه از نشانگر SSR در برنامه­هاي گزينش استفاده شود.