استفاده از ابزارهاي بيوانفورماتيكي براي مطالعه پروتئين مايوستاتين

ژن مايوستاتين متعلق به خانواده فاكتورهاي تمايز رشد (TGF-β) مي­باشد كه در رشد و نمو و بلوغ و به­طور اختصاصي در توسعه ماهيچه اسكلتي بالغ بيان مي­شود. در اين پژوهش با بهره­ گيري از نرم­افزارهاي بيوانفورماتيكي، توالي­ اسيدآمينه­اي پروتئين مايوستاتين در گونه­هاي مختلف ازجمله گاو، گوسفند، بز، اسب، خوك، مرغ، بوقلمون، اردك، غاز، كبوتر، موش و انسان بررسي شد. در هم­رديفي بخش پاياني پروتئين مايوستاتين (فرم فعال پروتئين مايوستاتين كه به­صورت دايمر بيان مي­شود)، درجه بالايي از حفاظت شدگي مشاهده شد، به­طوري­كه نوسان تغييرات در اين بخش نسبت به ساير قسمت هاي توالي پروتئيني، كمترين مقدار ممكن بود. با استفاده از سايت­هاي تخصصي Proteus و Phyre2 ساختارهاي ثانويه­اي از قبيل مارپيچ آلفا، صفحات بتا و ساختار سه بعدي پروتئين مايوستاتين مورد بررسي قرار گرفت. اسيدآمينه­هاي لوسين، ليزين، ايزولوسين و گلوتاميك اسيد در گاو و گوسفند و بز فراواني يكساني را نشان دادند اما در مقايسه با ماكيان مانند مرغ، فراواني بيشتري داشتند. حال آن­كه فراواني اين اسيدآمينه­ها در توالي پروتئيني مايوستاتين انسان و خوك متوسط بود. بررسي درخت فيلوژني نشان داد كه تفاوت در توالي اسيدآمينه­اي مايوستاتين در بين گونه­هاي ياد شده باعث قرار گرفتن پرندگان در گروهي جدا شده از پستانداران شده است. بررسي ساختار سه بعدي نشان داد كه ژن مايوستاتين داراي حفاظت شدگي بالايي در گونه ها است.