بررسي مولكولي و فعاليت ضد ميكروبي باكتري‌هاي جداشده از درياي خزر

The survey of molecular and antimicrobial activity of isolated bacteria from the Caspian sea

زمينه و هدف: ميكروارگانيسم هاي آبزي توانايي شگرفي در توليد مواد ضد ميكروبي عليه باكتري هاي پاتوژن دارند. در اين مطالعه جداسازي اين ميكروارگانيسم ها و سنجش اثر ضد ميكروبي آن ها عليه برخي پاتوژن هاي بيماري زا انجام شد. روش بررسي: نمونه ها در فصل پاييز و از غرب درياي خزر جمع آوري شدند، نمونه هاي جداشده تخليص و اثر آن ها بر برخي پاتوژن هاي بيماري زا با استفاده از دو روش سنجيده شد. سويه هاي داراي اثر ضد ميكروبي بر پاتوژن هاي شاخص، ماده ژنتيكي موجود در آن ها (DNA) استخراج و با استفاده از پرايمرهاي جهاني واكنش زنجيري پليمراز انجام شد. سويه هاي جداشده با استفاده از تكنيك مولكولي 16SrDNA PCR sequencing شناسايي و به عنوان سويه هاي جديد آبزي در پايگاه بانك اطلاعات ژني ثبت شدند. يافته ها: نتايج نشان داد سويه هاي داراي خاصيت ضد ميكروبي اثر قابل توجهي بر پاتوژن هاي گرم مثبت داشتند، بطوريكه گرم مثبت ها تقريباً در اكثر موارد مهار شدند اما اثر ضد ميكروبي اين سويه ها در برابر گرم منفي ها بسيار ناچيز بود و تنها در چند مورد مشاهده شد. شناسايي سويه هاي داراي اثر ضد ميكروبي نشان داد كه متعلق به جنس باسيلوس ها مي باشند. نتيجه گيري: مي توان از توانايي اين باكتري هاي آبزي جهت كنترل رشد پاتوژن هاي مقاوم به دارو كه تهديد جدي براي سلامت انساني مي باشند استفاده كرد. همچنين با بهينه سازي شرايط توليد ماده ضد ميكروبي در آن ها و تخليص در شرايط صنعتي مي توان كيفيت و مقدار عصاره ضد ميكروبي تخليص شده از آن ها را جهت استفاده در صنايع مختلف مانند صنعت دارويي افزايش داد.

Background and Aim: Marine microorganisms have an astonishing potential for producing antimicrobial substances against pathogenic bacteria. In this study, isolation and measurement of antimicrobial activity among these microorganisms against some pathogenic bacteria was carried out. Materials and methods: Samples were collected in autumn from the west of the Caspian Sea. Isolated samples were purified and antimicrobial activity among these samples against some pathogenic bacteria were measured by the use of two methods. At the end, genetic substance (DNA) of the strains with antimicrobial effect against pathogenic bacteria was extracted and polymerase chain reaction with universal primers was carried out. Isolated strains were identified by molecular method (16SrDNA PCR sequencing) and the strains were submitted and registered as new marine strains in the NCBI. Results: Results showed, the strains with antimicrobial activity had a noticeable effect on gram positive bacteria. So that gram positive bacteria were nearly inhibited in all cases but antimicrobial activity was restricted against gram negative bacteria, because gram negative bacteria were inhibited only in few cases. Finally, identification of stains with antimicrobial effect showed, the strains belong to Bacillus genus. Conclusion: According to this resu we can use marine bacteria for controlling growth of pathogenic bacteria that are resistant to drugs and as a big threat for the human health. Also we can optimize conditions for producing antimicrobial substances among them and we can extract them in industrial conditions for increasing quality and quantity antimicrobial substances in these bacteria for the use in different industries such as pharmaceutical industry.