بررسي ژن هاي رفرنس موجود در برگ كنجد تحت تنش شوري به روش Real- Time PCR

تجزيه و تحليل بيان ژن جزء لاينفك مطالعات ژنوميكس كاربردي در همه موجودات زنده بشمار مي رود. Real-time PCR تكنيك بسيار قوي براي بررسي بيان كمي ژن مي باشد. با اين حال، علاوه بر قابل اعتماد بودن، داراي يك سري مشكلات خاص، از جمله انتخاب ژن (هاي) كنترل داخلي مناسب براي نرمال سازي داده ها مي باشد. اين تحقيق در خصوص انتخاب ژن هاي رفرنس در گياه كنجد در مراحل مختلف نمو و تحت تنش شوري، مورد بررسي قرار گرفت .بدين منظور چهار ژن كنترل داخلي شامل Alpha- Tubulin، Beta- Actin، eIF4- A و UBQ5 كه معمولاً به عنوان ژن خانه دار در گياهان استفاده مي شود انتخاب و پايداري بيان آنها در سطوح مختلف شوري (صفر و 75 ميلي مولار) و مراحل مختلف نموي در شش دوره زماني (0 ساعت، 6 ساعت، 1 روز، 4 روز، 8 روز و 16 روز) در بافت برگ مورد بررسي قرار گرفتند. بررسي بيان ژن هاي رفرنس با استفاده از نرم افزار geNORM نشان داد كه ژن هاي eIF4- A و Beta-Actin از پايداري بيان بيشتري نسبت به ساير ژن هاي مورد بررسي در مراحل نمو و تنش شوري در نمونه بافت برگي برخوردار بودند. استفاده از اين ژن ها مي تواند در نرمال سازي بيان ژن به وسيله آناليز Real-Time PCR مفيد باشد. نتايج اين تحقيق را مي توان به عنوان ژن هاي رفرنس درآناليز بيان ژن در Real-Time PCR در گياه كنجد استفاده نمود.